当前蛋白身份：Q5NCY0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4EYU The free structure of the mouse C-terminal domain of KDM6B 提交 2012-05-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1155–1293（139 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
链 A
1321–1641（321 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；298 K；11% methanol, 6% MPD, 5% PEG 4K, 5% GLYCEROL, HEPES pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 4EYU The free structure of the mouse C-terminal domain of KDM6B 提交 2012-05-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1155–1293（139 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
链 B
1321–1641（321 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；298 K；11% methanol, 6% MPD, 5% PEG 4K, 5% GLYCEROL, HEPES pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 4EZ4 free KDM6B structure 提交 2012-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1155–1293（139 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
链 A
1321–1641（321 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；293 K；11% methanol, 6% MPD, 5% PEG 4K, 5% Glycerol, HEPES pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.250 |
| 4EZ4 free KDM6B structure 提交 2012-05-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1155–1293（139 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
链 B
1321–1641（321 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；293 K；11% methanol, 6% MPD, 5% PEG 4K, 5% Glycerol, HEPES pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.250 |
| 4EZH the crystal structure of KDM6B bound with H3K27me3 peptide 提交 2012-05-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1155–1293（139 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
链 A
1321–1641（321 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；293 K；11% methanol, 6% MPD, 5% PEG 4K, 5% Glycerol, HEPES 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.254 |
| 4EZH the crystal structure of KDM6B bound with H3K27me3 peptide 提交 2012-05-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1155–1293（139 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
链 B
1321–1641（321 aa）
片段：UNP residues 1155-1641
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；293 K；11% methanol, 6% MPD, 5% PEG 4K, 5% Glycerol, HEPES 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.254 |
| 9NQU KDM6B-nucleosome structure stabilized by H3K27C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2025-03-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 K
1130–1641（512 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.16 Å |