当前蛋白身份：Q5QGG3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3IK5 SIVmac239 Nef in complex with TCR zeta ITAM 1 polypeptide (A63-R80) 提交 2009-08-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
95–235（141 aa）
片段：core domain
链 C
95–235（141 aa）
片段：core domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 3350, 0.2mM ammonmium fluoride, 0.1mM hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.184 |
| 3IK5 SIVmac239 Nef in complex with TCR zeta ITAM 1 polypeptide (A63-R80) 提交 2009-08-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
95–235（141 aa）
片段：core domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 3350, 0.2mM ammonmium fluoride, 0.1mM hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.184 |
| 3IK5 SIVmac239 Nef in complex with TCR zeta ITAM 1 polypeptide (A63-R80) 提交 2009-08-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
95–235（141 aa）
片段：core domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 3350, 0.2mM ammonmium fluoride, 0.1mM hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.05 Å R-free 0.184 |
| 3IOZ SIVmac239 Nef in complex with a TCR zeta polypeptide DP1 (L51-D93) 提交 2009-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
95–235（141 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；15% PEG 3350, 0.15M KF, 0.1M hepes, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 3.70 Å R-free 0.329 |
| 3RWC Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW9 提交 2011-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
165–173（9 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 3RWC Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW9 提交 2011-05-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
165–173（9 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 3RWD rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW11 提交 2011-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
165–175（11 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.277 |
| 3RWD rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW11 提交 2011-05-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
165–175（11 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.277 |
| 3RWF Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-QW9 提交 2011-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
199–207（9 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 3RWG Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-MW9 提交 2011-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
195–203（9 aa）
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未记录 | XPE 3,6,9,12,15,18,21,24,27-NONAOXANONACOSANE-1,29-DIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 5NUH Crystal structure of SIVmac239 Nef bound to an engineered Hck SH3 domain 提交 2017-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
68–235（168 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；12% PEG 3350, 0.15 M tri-lithium-citrat, 1% 1.6 hexandiol
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分辨率 2.78 Å R-free 0.229 |
| 5NUH Crystal structure of SIVmac239 Nef bound to an engineered Hck SH3 domain 提交 2017-04-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
68–235（168 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；12% PEG 3350, 0.15 M tri-lithium-citrat, 1% 1.6 hexandiol
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.229 |
| 5NUI Crystal structure of SIVmac239 Nef in an ExxxLM endocytic sorting motif bound state 提交 2017-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
87–235（149 aa）
链 B
87–235（149 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% PEG 4000, 0.15 M ammonium sulfate, 0.1 M MES (pH 5.8)
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分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |