当前蛋白身份:Q5VTY9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6UJO HHAT L75F Neoantigen Peptide KQWLVWLFL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 68–76(9 aa) 片段:Neoantigen peptide (UNP residues 68-76)
突变:L75F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295.5 K;10% PEG3350, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 6.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.222
6UJQ HHAT Wild Type Peptide KQWLVWLLL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 68–76(9 aa) 片段:wild type peptide (UNP residues 68-76)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.1;295.5 K;0.1 M Tris-HCl, pH 8.1, 30% PEG4000, 0.20 M ammonium sulfate
分辨率 2.55 Å R-free 0.228
6UK2 Complex of T cell Receptor with HHAT Wild Type Peptide KQWLVWLLL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 68–76(9 aa) 片段:Neoantigen peptide (UNP residues 68-76)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;277 K;0.1 M sodium citrate, pH 6.3, 8.5% PEG6000, 0.20 M lithium nitrate
分辨率 3.14 Å R-free 0.260
6UK4 Complex of T cell Receptor with HHAT Neoantigen Peptide KQWLVWLFL Presented by HLA-A206 提交 2019-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 68–76(9 aa) 片段:Neoantigen peptide (UNP residues 68-76)
突变:L75F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;277 K;0.1 M sodium citrate, pH 6.3, 7.5% PEG6000, 0.2 M lithium nitrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
7MHY Human Hedgehog acyltransferase (HHAT) in complex with palmitoyl-CoA and two Fab antibody fragments 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–493(493 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PKZ Palmitoyl-CoA × 3 AJP Digitonin × 14 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7MHZ Human Hedgehog acyltransferase (HHAT) in complex with a palmitoylated Hedgehog peptide product and a Fab antibody fragment 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–493(493 aa)
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PKZ Palmitoyl-CoA × 3 AJP Digitonin × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Q1U Structure of Hedgehog acyltransferase (HHAT) in complex with megabody 177 bound to non-hydrolysable palmitoyl-CoA (Composite Map) 提交 2021-10-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–493(493 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CLR CHOLESTEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 HD6 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-3-phosphonooxy-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(3~{S})-4-[[3-(2-hexadecylsulfanylethylamino)-3-oxidanylidene-propyl]amino]-2,2-dimethyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-butyl] hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PLM PALMITIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7Q6Z Structure of Hedgehog acyltransferase (HHAT) in complex with megabody 177 bound to IMP-1575 提交 2021-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–493(493 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 9V3 2-(2-methylpropylamino)-1-[(4R)-4-(6-methylpyridin-2-yl)-6,7-dihydro-4H-thieno[3,2-c]pyridin-5-yl]ethanone × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
7URF Human HHAT H379C in complex with SHH N-terminal peptide 提交 2022-04-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–493(493 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 PKZ Palmitoyl-CoA × 2 AJP Digitonin × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å