当前蛋白身份:Q5ZUV9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5CQC Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ 提交 2015-07-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 10–458(449 aa)
未记录 BA BARIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.1;277.15 K;12% PEG 3350, 0.2 M BaCl2, 0.1 M MES
分辨率 2.98 Å R-free 0.250
5HZY Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - P6322 提交 2016-02-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 49–502(454 aa) 片段:UNP residues 49-502
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.8M Sodium Acetate trihydrate, 200mM NaCl
分辨率 2.55 Å R-free 0.213
5HZY Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - P6322 提交 2016-02-03 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 49–502(454 aa) 片段:UNP residues 49-502
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.8M Sodium Acetate trihydrate, 200mM NaCl
分辨率 2.55 Å R-free 0.213
5IO3 Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - I422 提交 2016-03-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–502(502 aa)
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;2.2M NaCl, 28% PEG 3350, 0.1M Imidazole pH6.5
分辨率 2.74 Å R-free 0.287
5IZV Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - F222 提交 2016-03-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–502(502 aa)
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;2M NaCl, 20% PEG 3350, 0.1M MgCl2, 0.1M Imidazole pH 6.5
分辨率 2.81 Å R-free 0.227
5IZV Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - F222 提交 2016-03-26 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–502(502 aa)
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;2M NaCl, 20% PEG 3350, 0.1M MgCl2, 0.1M Imidazole pH 6.5
分辨率 2.81 Å R-free 0.227
5IZV Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - F222 提交 2016-03-26 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–502(502 aa)
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;2M NaCl, 20% PEG 3350, 0.1M MgCl2, 0.1M Imidazole pH 6.5
分辨率 2.81 Å R-free 0.227
5IZV Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ - F222 提交 2016-03-26 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–502(502 aa)
突变:C258S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;2M NaCl, 20% PEG 3350, 0.1M MgCl2, 0.1M Imidazole pH 6.5
分辨率 2.81 Å R-free 0.227
5MS2 Crystal structure of the Legionella pneumophila effector protein RavZ in complex with human LC3B 提交 2016-12-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–431(431 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277.15 K;0.17 M ammonium acetate, 0.085M tri sodium citrate, 25.5% PEG 4000 and 15% glycerol
分辨率 2.47 Å R-free 0.238
5MS5 Low-salt structure of RavZ LIR2-fused human LC3B 提交 2016-12-31 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–36(13 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.1 M citric acid anhydrous and 1.6 M ammonium sulfate
分辨率 1.53 Å R-free 0.242
5MS5 Low-salt structure of RavZ LIR2-fused human LC3B 提交 2016-12-31 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 24–36(13 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;0.1 M citric acid anhydrous and 1.6 M ammonium sulfate
分辨率 1.53 Å R-free 0.242
5MS7 Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ_20-502 提交 2016-12-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–502(483 aa)
未记录 BA BARIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277.15 K;16% PEG3350, 0.2 M BaCl2 and 0.1 M MES
分辨率 2.80 Å R-free 0.254
5MS8 Crystal structure of the legionella pneumophila effector protein RavZ_1-487 提交 2016-12-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–487(487 aa)
未记录 BA BARIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277.15 K;16% PEG3350, 0.2 M BaCl2 and 0.1 M MES
分辨率 2.85 Å R-free 0.249