当前蛋白身份:Q5ZXN5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8AGG Structure of the Legionella phosphocholine hydrolase Lem3 提交 2022-07-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–570(570 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;MES 0.1M pH 5, PEG6000 5%
分辨率 3.60 Å R-free 0.299
8ALK Structure of the Legionella phosphocholine hydrolase Lem3 in complex with its substrate Rab1 提交 2022-08-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 21–486(466 aa)
突变:T391C, C395S, C134S, C209S, C456S CA CALCIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 OJU 2-[[[5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxyethyl-[3-(2-chloranylethanoylamino)propyl]-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;MES 0.1M pH 5, PEG6000 5%
分辨率 2.15 Å R-free 0.228
8ANP Legionella effector Lem3 mutant D190A in complex with Mg2+ 提交 2022-08-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 21–486(466 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES; 30% PEG 300
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
8ANP Legionella effector Lem3 mutant D190A in complex with Mg2+ 提交 2022-08-05 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 21–486(466 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES; 30% PEG 300
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
8ANP Legionella effector Lem3 mutant D190A in complex with Mg2+ 提交 2022-08-05 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 21–486(466 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES; 30% PEG 300
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
8ANP Legionella effector Lem3 mutant D190A in complex with Mg2+ 提交 2022-08-05 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 21–486(466 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;292 K;0.1 M MES; 30% PEG 300
分辨率 2.20 Å R-free 0.230