当前蛋白身份:Q5ZXN6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4BEP Crystal structure of the Legionella pneumophila FIC domain-containing effector AnkX protein (apo-form) 提交 2013-03-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
链 B 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE, 15-25% PEG 3350, 0.05 M HEPES PH 7.8-8.2
分辨率 3.14 Å R-free 0.286
4BER Crystal structure of the Legionella pneumophila FIC domain-containing effector AnkX protein in complex with cytidine monophosphate 提交 2013-03-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
突变:YES C5P CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;15% PEG 20000, 0.1 M TRIS PH 8.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
4BER Crystal structure of the Legionella pneumophila FIC domain-containing effector AnkX protein in complex with cytidine monophosphate 提交 2013-03-12 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
突变:YES C5P CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;15% PEG 20000, 0.1 M TRIS PH 8.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
4BES Crystal structure of the Legionella pneumophila FIC domain-containing effector AnkX protein in complex with cytidine monophosphate and phosphocholine 提交 2013-03-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
突变:YES C5P CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 PC PHOSPHOCHOLINE × 2 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;0.2 M AMMONIUM SULFATE, 30% PEG 5000 MME, 0.1 M MES PH 6.5
分辨率 2.54 Å R-free 0.259
4BET Crystal structure of the Legionella pneumophila FIC domain-containing effector AnkX protein (inactive H229A mutant) in complex with cytidine-diphosphate-choline 提交 2013-03-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
链 B 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
突变:YES 突变:YES CDC [2-CYTIDYLATE-O'-PHOSPHONYLOXYL]-ETHYL-TRIMETHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;0.2 M LITHIUM SULFATE, 14% PEG 4000, 0.1 M TRIS PH 7.5
分辨率 2.55 Å R-free 0.247
4BET Crystal structure of the Legionella pneumophila FIC domain-containing effector AnkX protein (inactive H229A mutant) in complex with cytidine-diphosphate-choline 提交 2013-03-12 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
链 B 2–484(483 aa) 片段:FIC AND ANKYRIN REPEATS DOMAINS, RESIDUES 2-484
突变:YES 突变:YES CDC [2-CYTIDYLATE-O'-PHOSPHONYLOXYL]-ETHYL-TRIMETHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;0.2 M LITHIUM SULFATE, 14% PEG 4000, 0.1 M TRIS PH 7.5
分辨率 2.55 Å R-free 0.247
6SKU Legionella effector AnkX in complex with human Rab1b 提交 2019-08-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–800(800 aa)
突变:C48S, C84S, G108C, C172S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;3.5 M Sodium formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.288