当前蛋白身份:Q61091 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1IJY CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYSTEINE-RICH DOMAIN OF MOUSE FRIZZLED 8 (MFZ8) 提交 2001-05-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 28–155(128 aa) 片段:CYSTEINE-RICH DOMAIN
链 B 28–155(128 aa) 片段:CYSTEINE-RICH DOMAIN
突变:N22E, N125E 突变:N22E, N125E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;293 K;Ammonium Sulfate, Hepes, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.35 Å R-free 0.247
4F0A Crystal structure of XWnt8 in complex with the cysteine-rich domain of Frizzled 8 提交 2012-05-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 28–150(123 aa) 片段:cysteine-rich domain, UNP residues 28-150
未记录 PAM PALMITOLEIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;4-10 % (w/v) PEG 400 15-25 mM Zinc acetate 100 mM Sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.25 Å R-free 0.234
6AHY Wnt signaling complex 提交 2018-08-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 28–159(132 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CL CHLORIDE ION × 1 PAM PALMITOLEIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.1 M LiCl, 20%(v/v) Ethylene glycol, 7%(w/v) PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
6AHY Wnt signaling complex 提交 2018-08-21 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 28–159(132 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PAM PALMITOLEIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.1 M LiCl, 20%(v/v) Ethylene glycol, 7%(w/v) PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
6AHY Wnt signaling complex 提交 2018-08-21 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 28–159(132 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES-NaOH (pH 7.5), 0.1 M LiCl, 20%(v/v) Ethylene glycol, 7%(w/v) PEG 4000
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
6TFB Carbamazepine binds Frizzled8 提交 2019-11-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 28–151(124 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 N6W benzo[b][1]benzazepine-11-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;300 K;0.1 M sodium acetate, pH 5 1 M ammonium sulphate
分辨率 1.68 Å R-free 0.265
6TFB Carbamazepine binds Frizzled8 提交 2019-11-13 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 28–151(124 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 N6W benzo[b][1]benzazepine-11-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;300 K;0.1 M sodium acetate, pH 5 1 M ammonium sulphate
分辨率 1.68 Å R-free 0.265
6TFM Frizzled8 CRD 提交 2019-11-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 28–151(124 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;300 K;0.1 M sodium acetate, pH 5 1 M ammonium sulphate
分辨率 2.34 Å R-free 0.300
6TFM Frizzled8 CRD 提交 2019-11-14 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 28–151(124 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;300 K;0.1 M sodium acetate, pH 5 1 M ammonium sulphate
分辨率 2.34 Å R-free 0.300
6TFM Frizzled8 CRD 提交 2019-11-14 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 28–151(124 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;300 K;0.1 M sodium acetate, pH 5 1 M ammonium sulphate
分辨率 2.34 Å R-free 0.300
6TFM Frizzled8 CRD 提交 2019-11-14 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 28–151(124 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;300 K;0.1 M sodium acetate, pH 5 1 M ammonium sulphate
分辨率 2.34 Å R-free 0.300
8CTG Extracellular architecture of an engineered canonical Wnt signaling ternary complex 提交 2022-05-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 28–150(123 aa)
未记录 PAM PALMITOLEIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 s blotting before plunging
分辨率 3.80 Å