当前蛋白身份:Q64537 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1AJ5 CALPAIN DOMAIN VI APO 提交 1997-05-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 12–184(173 aa) 片段:SMALL REGULATORY SUBUNIT, DOMAIN VI, MET 87 - SER 270
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8;38%SATURATED AMMONIUM SULFATE AND 25MM PIPES BUFFER, PH 6.8
分辨率 2.30 Å R-free 0.306
1AJ5 CALPAIN DOMAIN VI APO 提交 1997-05-15 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 12–184(173 aa) 片段:SMALL REGULATORY SUBUNIT, DOMAIN VI, MET 87 - SER 270
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8;38%SATURATED AMMONIUM SULFATE AND 25MM PIPES BUFFER, PH 6.8
分辨率 2.30 Å R-free 0.306
1DF0 Crystal structure of M-Calpain 提交 1999-11-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–184(184 aa) 片段:DOMAIN VI (CALCIUM-BINDING DOMAIN), SMALL (REGULATORY) SUBUNIT
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;298 K;PEG 6000, MES, SODIUM CHLORIDE, DITHIOTHREITOL, EDTA, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.60 Å R-free 0.293
1DVI CALPAIN DOMAIN VI WITH CALCIUM BOUND 提交 1997-05-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–184(184 aa) 片段:SMALL (REGULATORY) SUBUNIT, DOMAIN VI, RESIDUES 87 - 270
链 B 1–184(184 aa) 片段:SMALL (REGULATORY) SUBUNIT, DOMAIN VI, RESIDUES 87 - 270
未记录 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;17% PEG 8K, 50MM CACODYLATE PH. 6.5 , 10% GLYCEROL, 200MM CACL2
分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1NP8 18-k C-terminally trunucated small subunit of calpain 提交 2003-01-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 87–245(159 aa) 片段:residues 87-245
链 B 87–245(159 aa) 片段:residues 87-245
未记录 CD CADMIUM ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;294 K;PEG, cadmium chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.00 Å R-free 0.239
1U5I Crystal Structure analysis of rat m-calpain mutant Lys10 Thr 提交 2004-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 84–266(183 aa) 片段:residues 1-184
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;298 K;PEG 6000, MES, sodium chloride, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.86 Å R-free 0.283
3BOW Structure of M-calpain in complex with Calpastatin 提交 2007-12-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 88–270(183 aa) 片段:UNP residues 88-270
未记录 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;298 K;pH 6.5, microbatch under paraffin oil, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.258
3DF0 Calcium-dependent complex between m-calpain and calpastatin 提交 2008-06-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 87–270(184 aa) 片段:UNP residues 87-270
未记录 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;4-9% PEG 3350, 5-10 mM CaCl2, 50-100 mM NaOAc (pH 5.5) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.95 Å R-free 0.299