当前蛋白身份：Q6LDG3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3SG2 Crystal Structure of GCaMP2-T116V,D381Y 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：SEE REMARK 999
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突变：T116V,D381Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
| 3SG3 Crystal Structure of GCaMP3-D380Y 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：SEE REMARK 999
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突变：D380Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.199 |
| 3SG4 Crystal Structure of GCaMP3-D380Y, LP(linker 2) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：SEE REMARK 999
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突变：D380Y, LP(linker 2) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.213 |
| 3SG5 Crystal Structure of Dimeric GCaMP3-D380Y, QP(linker 1), LP(linker 2) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：SEE REMARK 999
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突变：D380Y, QP(linker 1), LP(linker 2) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 3SG6 Crystal Structure of Dimeric GCaMP2-LIA(linker 1) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：SEE REMARK 999
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突变：LIA(linker 1) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.249 |
| 3SG7 Crystal Structure of GCaMP3-KF(linker 1) 提交 2011-06-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：SEE REMARK 999
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突变：KF(linker 1) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 3WLC Crystal structure of dimeric GCaMP6m 提交 2013-11-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：UNP RESIDUES 37-55, 149-238, 2-144, 3-149
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突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, N61D, D79Y, M77G, K78S, T80R, S82T, R91G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M HEPES, 20% w/v PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.49 Å R-free 0.225 |
| 3WLD Crystal structure of monomeric GCaMP6m 提交 2013-11-08 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
片段：UNP RESIDUES 37-55, 149-238, 2-144, 3-149
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, N61D, D79Y, M77G, K78S, T80R, S82T, R91G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1M HEPES, 18% w/v PEG 3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.70 Å R-free 0.212 |
| 4I2Y Crystal Structure of the genetically encoded calcium indicator RGECO1 提交 2012-11-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
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突变：;Q44N, T46A, T62S, L65M, R68E, V71A, G74S, H77K, A79G, K81R, L89A, V90A, F92V, S94T, I95T, M97K, Y107A, Y109I, S112I, T117V, Y129C, T132A, R174H, T178S, G197A, H198F, N199Q, V201A, V228A, V230I, K240F, K249R, V261I, V262I, T263H, T265N, C274V, F281L, I282R, V284T, S288P, N363D, I366F, K380N, S404G, N414D, E430V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；73mM malonic acid, 10mM ammonium citrate tribasic, 5mM succinic acid, 12mM malic acid, 16mM sodium acetate trihydrate, 20mM sodium formate, 6mM ammonium tartrate dibasic, 12% PEG 3350, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 4I2Y Crystal Structure of the genetically encoded calcium indicator RGECO1 提交 2012-11-23 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
37–55（19 aa）
|
突变：;Q44N, T46A, T62S, L65M, R68E, V71A, G74S, H77K, A79G, K81R, L89A, V90A, F92V, S94T, I95T, M97K, Y107A, Y109I, S112I, T117V, Y129C, T132A, R174H, T178S, G197A, H198F, N199Q, V201A, V228A, V230I, K240F, K249R, V261I, V262I, T263H, T265N, C274V, F281L, I282R, V284T, S288P, N363D, I366F, K380N, S404G, N414D, E430V ; 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；73mM malonic acid, 10mM ammonium citrate tribasic, 5mM succinic acid, 12mM malic acid, 16mM sodium acetate trihydrate, 20mM sodium formate, 6mM ammonium tartrate dibasic, 12% PEG 3350, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 4OY4 calcium-free CaMPARI v0.2 提交 2014-02-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–55（19 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 10 mM EGTA
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分辨率 2.03 Å R-free 0.235 |