当前蛋白身份:Q6NZ36 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2MUQ Solution Structure of the Human FAAP20 UBZ 提交 2014-09-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 140–180(41 aa) 片段:UBZ, UNP residues 140-180
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1-0.125;压力 ambient
NMR样品组成 1.5 mM [U-100% 15N] protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2MUR Solution Structure of the Human FAAP20 UBZ-Ubiquitin Complex 提交 2014-09-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 140–180(41 aa) 片段:UBZ, UNP residues 140-180
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 2 mM UBZ, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 3 mM Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 3 mM UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 2 mM UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 142–180(39 aa) 片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 I 142–180(39 aa) 片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 142–180(39 aa) 片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.235
3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 L 142–180(39 aa) 片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.235