当前蛋白身份:Q6NZ36
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2MUQ Solution Structure of the Human FAAP20 UBZ 提交 2014-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
140–180(41 aa)
片段:UBZ, UNP residues 140-180
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1-0.125;压力 ambient
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 15N] protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 10 mM DTT, 0.05 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MUR Solution Structure of the Human FAAP20 UBZ-Ubiquitin Complex 提交 2014-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
140–180(41 aa)
片段:UBZ, UNP residues 140-180
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 2 mM UBZ, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
3 mM Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 3 mM UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 2 mM UBZ, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UBZ, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin, 25 mM sodium phosphate, 100 mM potassium chloride, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
142–180(39 aa)
片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
142–180(39 aa)
片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
142–180(39 aa)
片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 3WWQ Crystal structure of FAAP20 UBZ domain in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-06-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 L
142–180(39 aa)
片段:UBZ domain, UNP residues 142-180
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.8M DL-malic acid, 0.1M glycine, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |