当前蛋白身份：Q6PIZ8
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2EYR A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
42–226（185 aa）
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突变：T164C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；297 K；18% PEG 3350, 0.1M cacodylate, 0.2M lithium chloride, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 2EYR A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
42–226（185 aa）
|
突变：T164C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；297 K；18% PEG 3350, 0.1M cacodylate, 0.2M lithium chloride, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 2EYS A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
42–226（185 aa）
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突变：T164C | ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；297 K；9% PEG 3350, 0.1M cacodylate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
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分辨率 2.21 Å R-free 0.278 |
| 2EYS A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
42–226（185 aa）
|
突变：T164C | ACY ACETIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；297 K；9% PEG 3350, 0.1M cacodylate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.278 |
| 2EYT A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
42–226（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；297 K；0.2M sodium sulfate, 20% PEG 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 2EYT A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
42–226（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；297 K；0.2M sodium sulfate, 20% PEG 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 2EYT A structural basis for selection and cross-species reactivity of the semi-invariant NKT cell receptor in CD1d/glycolipid recognition 提交 2005-11-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
42–226（185 aa）
链 C
42–226（185 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；297 K；0.2M sodium sulfate, 20% PEG 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 2F53 Directed Evolution of Human T-cell Receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–210（169 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% Iso-propanol, 17% PEG4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.231 |
| 2F53 Directed Evolution of Human T-cell Receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–210（169 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% Iso-propanol, 17% PEG4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.231 |
| 2F54 Directed evolution of human T cell receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without increasing apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
42–224（183 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% iso-propanol, 17% PEG 4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.286 |
| 2F54 Directed evolution of human T cell receptor CDR2 residues by phage display dramatically enhances affinity for cognate peptide-MHC without increasing apparent cross-reactivity 提交 2005-11-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
42–224（183 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；85 mM HEPES, 8.5% iso-propanol, 17% PEG 4000, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.286 |
| 2P5W Crystal structures of high affinity human T-cell receptors bound to pMHC reveal native diagonal binding geometry 提交 2007-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
24–210（187 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 11 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；85 MM HEPES, 8.5% ISO-PROPANOL, 17% PEG4000, 15% GLYCEROL, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 7.50
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分辨率 2.20 Å R-free 0.245 |
| 2PO6 Crystal structure of CD1d-lipid-antigen complexed with Beta-2-Microglobulin, NKT15 Alpha-Chain and NKT15 Beta-Chain 提交 2007-04-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
122–223（102 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；13% PEG 10K, 0.1M bis-tris propane, 0.2M tri-sodium citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.293 |
| 2PO6 Crystal structure of CD1d-lipid-antigen complexed with Beta-2-Microglobulin, NKT15 Alpha-Chain and NKT15 Beta-Chain 提交 2007-04-25 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
122–223（102 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 AGH N-{(1S,2R,3S)-1-[(ALPHA-D-GALACTOPYRANOSYLOXY)METHYL]-2,3-DIHYDROXYHEPTADECYL}HEXACOSANAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；13% PEG 10K, 0.1M bis-tris propane, 0.2M tri-sodium citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.293 |
| 2PYF Crystal Structures of High Affinity Human T-Cell Receptors Bound to pMHC RevealNative Diagonal Binding Geometry Unbound TCR Clone 5-1 提交 2007-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–215（191 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；85 mM Na HEPES buffer pH7.5, 8.5 % iso-propanol, 17% PEG 4000, 15% glycerol, pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.295 |