当前蛋白身份:Q6PJF1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1RHH Crystal Structure of the Broadly HIV-1 Neutralizing Fab X5 at 1.90 Angstrom Resolution 提交 2003-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
25–256(232 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG400, HEPES, 1,2-propanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 1RHH Crystal Structure of the Broadly HIV-1 Neutralizing Fab X5 at 1.90 Angstrom Resolution 提交 2003-11-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
25–256(232 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;PEG400, HEPES, 1,2-propanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 2DD8 Crystal Structure of SARS-CoV Spike Receptor-Binding Domain Complexed with Neutralizing Antibody 提交 2006-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 H
20–256(237 aa)
片段:Fab m396, Heavy Chain
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;15v/v% Glycerol, 20% PEG 6000, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.261 |
| 2DD8 Crystal Structure of SARS-CoV Spike Receptor-Binding Domain Complexed with Neutralizing Antibody 提交 2006-01-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 H
20–256(237 aa)
片段:Fab m396, Heavy Chain
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;15v/v% Glycerol, 20% PEG 6000, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.261 |
| 2QL1 Structural Characterization of a Mutated, ADCC-Enhanced Human Fc Fragment 提交 2007-07-12 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
256–480(225 aa)
片段:Antibody Fc fragment
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;298 K;8% PEG 3350, 200 mM Zn Acetate, 5% Glycerol, 0.1 M Imidazole -Malate buffer, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298.0K
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分辨率 2.53 Å R-free 0.293 |
| 3C2S Structural Characterization of a Human Fc Fragment Engineered for Lack of Effector Functions 提交 2008-01-25 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
256–480(225 aa)
片段:ANTIBODY FC FRAGMENT, residues 256-480
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突变:L234F, L234E,P331S | ZN ZINC ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;298 K;5% PEG 3350, 200 mM Zn Acetate, 0.1 M Imidazole Malate, 5% Glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298.0K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.275 |