当前蛋白身份:Q6RFH5 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8FKP Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State A1) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:47-meric(47) 与全部聚合物一致
链 NQ 1–385(385 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the Vitrobot.
分辨率 2.85 Å
8FKR Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State B1) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 NQ 1–385(385 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 54 ZN ZINC ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
分辨率 2.89 Å
8FKT Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State C1) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:53-meric(53) 与全部聚合物一致
链 NQ 1–385(385 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 64 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
分辨率 2.81 Å
8FKV Human nucleolar pre-60S ribosomal subunit (State D1) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 NQ 1–385(385 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 65 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
分辨率 2.47 Å