当前蛋白身份:Q6TEK8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6WV8 Takifugu rubripes VKOR-like C138S mutant with vitamin K1 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
6–175(170 aa)
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突变:C138S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PQN PHYLLOQUINONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6;295 K;25% PEG 400, 300 mM ammonium fluoride, 0.1 M MES pH 6.0
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分辨率 3.01 Å R-free 0.293 |
| 6WV9 Takifugu rubripes VKOR-like with vitamin K1 in noncatalytic state 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
6–175(170 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.5;295 K;42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5.
protein-ligand co-crystallization
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分辨率 3.35 Å R-free 0.282 |
| 6WVA Takifugu rubripes VKOR-like with vitamin K1 epoxide at non-catalytic state 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
6–175(170 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.5;295 K;42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5
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分辨率 3.35 Å R-free 0.278 |
| 6WVB Takifugu rubripes VKOR-like with warfarin 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
6–175(170 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SWF S-WARFARIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5.5;295 K;23% PEG400, 0.1 M Sodium nitrate, 0.1 M MES pH 5.5
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分辨率 2.87 Å R-free 0.286 |
| 6WVI VKOR-like from Takifugu rubripes 提交 2020-05-06 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
6–175(170 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.5;295 K;42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5
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分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |