当前蛋白身份:Q6TEK8 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6WV8 Takifugu rubripes VKOR-like C138S mutant with vitamin K1 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–175(170 aa)
突变:C138S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PQN PHYLLOQUINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6;295 K;25% PEG 400, 300 mM ammonium fluoride, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 3.01 Å R-free 0.293
6WV9 Takifugu rubripes VKOR-like with vitamin K1 in noncatalytic state 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–175(170 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.5;295 K;42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5. protein-ligand co-crystallization
分辨率 3.35 Å R-free 0.282
6WVA Takifugu rubripes VKOR-like with vitamin K1 epoxide at non-catalytic state 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–175(170 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.5;295 K;42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 3.35 Å R-free 0.278
6WVB Takifugu rubripes VKOR-like with warfarin 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–175(170 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SWF S-WARFARIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5.5;295 K;23% PEG400, 0.1 M Sodium nitrate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.87 Å R-free 0.286
6WVI VKOR-like from Takifugu rubripes 提交 2020-05-06 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 6–175(170 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 7.5;295 K;42% PEG 400, 50 mM ammonium formate, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.235