当前蛋白身份:Q7BU69 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3EB8 VirA 提交 2008-08-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 45–400(356 aa) 片段:delta44
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.267
3EB8 VirA 提交 2008-08-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 45–400(356 aa) 片段:delta44
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.267
3EB8 VirA 提交 2008-08-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 45–400(356 aa) 片段:delta44
链 B 45–400(356 aa) 片段:delta44
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.267
3EE1 Novel fold of VirA, a type III secretion system effector protein from Shigella flexneri 提交 2008-09-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 14–400(387 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.01 Å R-free 0.256
3EE1 Novel fold of VirA, a type III secretion system effector protein from Shigella flexneri 提交 2008-09-03 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 14–400(387 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.01 Å R-free 0.256
4FMB VirA-Rab1 complex structure 提交 2012-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 45–400(356 aa)
未记录 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6;298 K;0.8 M ammonium sulfate and 0.1 M Tris-HCl (pH 7.6), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.247
4FMB VirA-Rab1 complex structure 提交 2012-06-16 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 45–400(356 aa)
未记录 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6;298 K;0.8 M ammonium sulfate and 0.1 M Tris-HCl (pH 7.6), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.247
4FMB VirA-Rab1 complex structure 提交 2012-06-16 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 45–400(356 aa)
未记录 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6;298 K;0.8 M ammonium sulfate and 0.1 M Tris-HCl (pH 7.6), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.247
4FMB VirA-Rab1 complex structure 提交 2012-06-16 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 45–400(356 aa)
链 C 45–400(356 aa)
链 E 45–400(356 aa)
未记录 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6;298 K;0.8 M ammonium sulfate and 0.1 M Tris-HCl (pH 7.6), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.247