当前蛋白身份：Q7L8A9
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6J4U Structural basis of tubulin detyrosination by vasohibins-SVBP enzyme complex and functional implications 提交 2019-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
57–307（251 aa）
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突变：E71S/A72H/K79M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5；293 K；by introducing three mutations E71S/A72H/K79M into V1c allowed us to solve the V1c-SVBP to high resolution. Well diffracting crystals of the mutant V1c-SVBP complex were obtained in 1.0 M lithium chloride, 0.1 M citric acid, pH 5.0, 20% PEG 6000.
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分辨率 2.00 Å R-free 0.204 |
| 6J7B Crystal structure of VASH1-SVBP in complex with epoY 提交 2019-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
57–306（250 aa）
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未记录 | BJL N-[(3R)-4-ethoxy-3-hydroxy-4-oxobutanoyl]-L-tyrosine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6；293 K；20%PEG6000, 1M lithium chloride, 0.1M MES pH6.0
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分辨率 1.62 Å R-free 0.197 |
| 6J8F Crystal structure of SVBP-VASH1 with peptide mimic the C-terminal of alpha-tubulin 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
70–306（237 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 18% PEG 20000
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分辨率 2.28 Å R-free 0.237 |
| 6J8N Crystal structure of SVBP-VASH1 complex, mutation C169A of VASH1 提交 2019-01-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
70–306（237 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% v/v Tacsimate pH6.0, 0.1M MES monohydrate pH 6.0, 25% PEG 4000
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分辨率 1.95 Å R-free 0.210 |
| 6J8N Crystal structure of SVBP-VASH1 complex, mutation C169A of VASH1 提交 2019-01-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
70–306（237 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% v/v Tacsimate pH6.0, 0.1M MES monohydrate pH 6.0, 25% PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.210 |
| 6J8O Structure of a hypothetical protease 提交 2019-01-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
70–306（237 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M BIS-TRIS pH 6.5, 16% polyethylene glycol 10000
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分辨率 1.85 Å R-free 0.195 |
| 6J91 Structure of a hypothetical protease 提交 2019-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
70–306（237 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 16% PEG 8000, 0.01M Cadmium chloride hydrate
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分辨率 3.50 Å R-free 0.258 |
| 6J9H Crystal structure of SVBP-VASH1 complex 提交 2019-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
70–306（237 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 16% PEG 8000, 0.01M Cadmium chloride hydrate
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分辨率 2.31 Å R-free 0.271 |
| 6J9H Crystal structure of SVBP-VASH1 complex 提交 2019-01-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
70–306（237 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 16% PEG 8000, 0.01M Cadmium chloride hydrate
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.271 |
| 6K81 Crystal structure of human VASH1-SVBP complex 提交 2019-06-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–365（365 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；Calcium acetate, PEG 3000
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分辨率 2.28 Å R-free 0.242 |
| 6LPG human VASH1-SVBP complex 提交 2020-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–310（255 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.16 M ammonium sulfate, 0.08 M Sodium acetate pH4.6, 20%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glycerol
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分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 6NVQ Crystal structure of the VASH1-SVBP complex 提交 2019-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–315（315 aa）
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突变：C169A | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；19% PEG 3000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M calcium chloride
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分辨率 2.10 Å R-free 0.214 |
| 6OCF The crystal structure of VASH1-SVBP complex 提交 2019-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
58–305（248 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.0, and 18% (w/v) PEG20000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.222 |
| 6OCG Crystal structure of VASH1-SVBP complex bound with EpoY 提交 2019-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
59–305（247 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 BJL N-[(3R)-4-ethoxy-3-hydroxy-4-oxobutanoyl]-L-tyrosine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；5% (v/v) TacsimateTM, 0.1 M HEPES, pH 7.0, and 10% (w/v) polyethylene glycol monomethyl ether 5,000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.219 |
| 6OCH Crystal structure of VASH1-SVBP complex bound with parthenolide 提交 2019-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
61–302（242 aa）
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未记录 | M4Y parthenolide × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-tris, pH 5.5, and 25 % (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 6OCH Crystal structure of VASH1-SVBP complex bound with parthenolide 提交 2019-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
61–302（242 aa）
|
未记录 | M4Y parthenolide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-tris, pH 5.5, and 25 % (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 6WSL Cryo-EM structure of VASH1-SVBP bound to microtubules 提交 2020-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
52–310（259 aa）
链 G
52–310（259 aa）
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未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å |