当前蛋白身份:Q7LDG7
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2MA2 Solution structure of RasGRP2 EF hands bound to calcium 提交 2013-06-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
417–497(81 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;304 K;离子强度(mmCIF原始值)0.125;压力 ambient
NMR样品组成
500 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] RasGRP2, 25 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 7 % D2O, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
500 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] RasGRP2, 25 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 7 % D2O, 17 mg/mL Pf1 phage, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 I
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 K
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 M
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |
| 6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 O
63–456(394 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.258 |