当前蛋白身份:Q7LDG7 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2MA2 Solution structure of RasGRP2 EF hands bound to calcium 提交 2013-06-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 417–497(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;304 K;离子强度(mmCIF原始值)0.125;压力 ambient
NMR样品组成 500 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] RasGRP2, 25 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 7 % D2O, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 500 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] RasGRP2, 25 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 7 % D2O, 17 mg/mL Pf1 phage, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 I 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258
6AXF Structure of RasGRP2 in complex with Rap1B 提交 2017-09-06 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 O 63–456(394 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;293 K;17% PEG3350 and 10 mM sodium citrate (pH 5.6)
分辨率 3.10 Å R-free 0.258