当前蛋白身份：Q86US8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2DOK Crystal structure of the PIN domain of human EST1A 提交 2006-05-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1239–1419（181 aa）
片段：PIN domain, Residues 6-186
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；278 K；1.26M (NH4)2SO4, 0.1M CHES-NaOH, 0.2M NaCl, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278.0K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.254 |
| 2DOK Crystal structure of the PIN domain of human EST1A 提交 2006-05-01 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1239–1419（181 aa）
片段：PIN domain, Residues 6-186
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；278 K；1.26M (NH4)2SO4, 0.1M CHES-NaOH, 0.2M NaCl, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.254 |
| 2DOK Crystal structure of the PIN domain of human EST1A 提交 2006-05-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1239–1419（181 aa）
片段：PIN domain, Residues 6-186
链 B
1239–1419（181 aa）
片段：PIN domain, Residues 6-186
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；278 K；1.26M (NH4)2SO4, 0.1M CHES-NaOH, 0.2M NaCl, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.254 |
| 2HWW Structure of PIN domain of human SMG6 提交 2006-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1239–1419（181 aa）
片段：PIN Domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；291 K；Jeffamine 2000 32%, 0.1M Hepes pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.267 |
| 2HWW Structure of PIN domain of human SMG6 提交 2006-08-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1239–1419（181 aa）
片段：PIN Domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；291 K；Jeffamine 2000 32%, 0.1M Hepes pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.267 |
| 2HWW Structure of PIN domain of human SMG6 提交 2006-08-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1239–1419（181 aa）
片段：PIN Domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；291 K；Jeffamine 2000 32%, 0.1M Hepes pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.267 |
| 2HWX Structure of human SMG6 E1282C PIN domain mutant. 提交 2006-08-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1239–1419（181 aa）
片段：PIN domain
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突变：E1282C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；291 K；20% Jeffamine 2000, 0.1M Hepes 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 4UM2 Crystal structure of the TPR domain of SMG6 提交 2014-05-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
580–1166（587 aa）
片段：TETRATRICOPEPTIDE REPEAT, RESIDUES 580-1166
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；50MM MES PH 5.5, 200MM AMMONIUM ACETATE, 2.5% 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
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分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 8RXB Human UPF1 CH domain in complex with SMG6 peptide 提交 2024-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
404–418（15 aa）
链 F
404–418（15 aa）
链 G
404–418（15 aa）
链 J
404–418（15 aa）
链 N
404–418（15 aa）
链 Q
404–418（15 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；solution (28% (w/v) PEG 3500, 0.2M Lithium sulfate and 0.1 M Tris pH 7.8)
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分辨率 2.60 Å R-free 0.295 |