当前蛋白身份：Q86Y38
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6EJ7 Human Xylosyltransferase 1 in complex with UDP-xylose and peptide QEEEGAGGGQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 UDX URIDINE-5'-DIPHOSPHATE-XYLOPYRANOSE × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus precipitant mix 2 (PEG8000 and ethylene glycol),
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1 M of Morpheus NPS mix.
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分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 6EJ8 Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide QEEEGSGGGQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
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分辨率 2.09 Å R-free 0.223 |
| 6EJ9 Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide QEPEGSGGGQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.225 |
| 6EJA Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide QEEEYSGGGQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
片段：UNP residues 232-959
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.212 |
| 6EJB Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide QEEEGSAGGQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
片段：UNP residues 232-959
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.280 |
| 6EJC Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide QEEEGSGVGQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
片段：UNP residues 232-959
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.273 |
| 6EJD Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide QEEEGSGGPQGG 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
片段：UNP residues 232-959
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
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分辨率 2.68 Å R-free 0.279 |
| 6EJE Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide PAAEGSGEQDFT 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
片段：UNP residues 232-959
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
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分辨率 2.43 Å R-free 0.235 |
| 6FOA Human Xylosyltransferase 1 apo structure 提交 2018-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
232–959（728 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% precipitant mix 2 (PEG8000 and ethylene glycol),
100 mM Bicine/Tris buffer at pH 7.5
100 mM of a sodium nitrate/sodium phosphate/ammonium sulphate mix.
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分辨率 1.87 Å R-free 0.222 |