当前蛋白身份:Q8DIS5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2YBV STRUCTURE OF RUBISCO FROM THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS 提交 2011-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A
1–475(475 aa)
链 C
1–475(475 aa)
链 E
1–475(475 aa)
链 G
1–475(475 aa)
链 I
1–475(475 aa)
链 K
1–475(475 aa)
链 M
1–475(475 aa)
链 O
1–475(475 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7;5% PEG8000, 20% PEG200, 10% GLYCEROL, 100MM HEPES, PH 7
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 3ZXW STRUCTURE OF ACTIVATED RUBISCO FROM THERMOSYNECHOCOCCUS ELONGATUS COMPLEXED WITH 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE 提交 2011-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A
1–475(475 aa)
链 C
1–475(475 aa)
链 E
1–475(475 aa)
链 G
1–475(475 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 22 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;80 MM HEPES, 20 MM MGCL2, 8% (W/V) PEG4000, 30% (V/V) GLYCEROL, PH=8
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.213 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 A1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 A8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 S1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 S8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 C1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 C8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 E1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 E8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 G1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 G8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 I1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 I8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 K1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 K8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 M1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 M8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 O1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 O8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |
| 6EKC Crystal structure of the BSD2 homolog of Arabidopsis thaliana bound to the octameric assembly of RbcL from Thermosynechococcus elongatus 提交 2017-09-26 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致 |
链 Q1
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q2
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q3
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q4
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q5
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q6
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q7
1–475(475 aa)
片段:RbcL
链 Q8
1–475(475 aa)
片段:RbcL
|
突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A 突变:F345I / P415A | ZN ZINC ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;21 % PEG 3350 and 0.12M DL-malic acid pH 7.0
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.274 |