当前蛋白身份:Q8IVS2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2C2N Structure of human mitochondrial malonyltransferase 提交 2005-09-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 60–375(316 aa) 片段:RESIDUES 60-375
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 AE4 3,6,9,12,15-PENTAOXAHEPTADECAN-1-OL × 1 DXE 1,2-DIMETHOXYETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;32%PEG4000, 0.25M LI2SO4, 100MM TRIS-HCL, PH8.5, SITTING DROP, 293 K, pH 8.50
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
2C2N Structure of human mitochondrial malonyltransferase 提交 2005-09-29 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 60–375(316 aa) 片段:RESIDUES 60-375
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 AE3 2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;32%PEG4000, 0.25M LI2SO4, 100MM TRIS-HCL, PH8.5, SITTING DROP, 293 K, pH 8.50
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
8CSP Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State A) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:33-meric(33) 与全部聚合物一致
链 8 1–390(390 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 28 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
8CSQ Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State B) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:33-meric(33) 与全部聚合物一致
链 8 1–390(390 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 27 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å
8CSR Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State C) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致
链 8 1–390(390 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 31 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å
8CSS Human mitochondrial small subunit assembly intermediate (State D) 提交 2022-05-13 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:33-meric(33) 与全部聚合物一致
链 8 1–390(390 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 32 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å