当前蛋白身份：Q8IY92
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4M7C Crystal structure of the TRF2-binding motif of SLX4 in complex with the TRFH domain of TRF2 提交 2013-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1014–1025（12 aa）
片段：TRF2-binding motif, UNP residues 1014-1025
链 D
1014–1025（12 aa）
片段：TRF2-binding motif, UNP residues 1014-1025
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；277 K；10% PEG 4000, 0.1M HEPES, pH 7.4, 100mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.262 |
| 4UYI Crystal structure of the BTB domain of human SLX4 (BTBD12) 提交 2014-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
668–796（129 aa）
片段：BTB DOMAIN (BTBD12), UNP RESIDUES 668-796
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突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, 25% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.194 |
| 4ZOU Crystal structure of the BTB domain of SLX4 提交 2015-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
669–787（119 aa）
片段：BTB domain (UNP RESIDUES 669-787)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；277 K；4-6% PEG 6000, 0.1 M HEPES, pH 7.6, 5% glycerol
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分辨率 2.15 Å R-free 0.244 |
| 7BU5 Crystal Structure of Human SLX4 and MUS81 提交 2020-04-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1550–1610（61 aa）
片段：SAP domain
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；277 K；25% w/v PEG 3350, 0.1M SPG (succinic acid: sodium dihydrogen phosphate: glycine, 2: 7: 7)
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.206 |
| 7TUJ NMR solution structure of the phosphorylated MUS81-binding region from human SLX4 提交 2022-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1528–1613（86 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0.125；压力 1
NMR样品组成
500 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Phosphorylated MUS81-binding region of human SLX4, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100 uM EDTA, 100 uM sodium azide, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 9QED Cryo-EM structure of the XPF-ERCC1-SLX4(330-555)-SLX4IP complex 提交 2025-03-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
330–555（226 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9QEE Cryo-EM structure of a DNA-bound XPF-ERCC1-SLX4(330-555)-SLX4IP complex 提交 2025-03-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 D
330–555（226 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å |