当前蛋白身份：Q8N5J2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5JKN Crystal structure of deubiquitinase MINDY-1 提交 2016-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–384（275 aa）
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未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 HG MERCURY (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；100mM Hepes-Na pH 7.5, 200mM NaCl and 25% PEG4000
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.242 |
| 5JQS Crystal structure of deubiquitinase MINDY-1 in complex with Ubiquitin 提交 2016-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
110–384（275 aa）
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未记录 | AYE prop-2-en-1-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；100mM MES, 10% Dioxane and 1.6 M ammonium sulphate
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分辨率 2.65 Å R-free 0.231 |
| 5MN9 Crystal structure of MINDY-1 tMIU in complex with K48-diUb 提交 2016-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
388–426（39 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293.15 K；100 mM sodium acetate pH 5.4 and 18.5 % PEG3350
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分辨率 2.05 Å R-free 0.223 |
| 6TUV Crystal structure of Mindy1 in complex with Lys48 linked di-ubiquitin 提交 2020-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
110–384（275 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；100 mM Tris-HCl, 200mM LiSO4.H2O, 30% PEG400
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分辨率 2.16 Å R-free 0.249 |
| 6TXB Crystal structure of Mindy1 mutant (P138A) in complex with Lys48 linked di-ubiquitin 提交 2020-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
110–384（275 aa）
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突变：C137A, P138A | NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.2 M Sodium malonate, 20% PEG 3350
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分辨率 2.18 Å R-free 0.246 |
| 6Y6R Crystal structure of MINDY1 T335D mutant 提交 2020-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–384（275 aa）
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突变：T335D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 0.8 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate
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分辨率 3.32 Å R-free 0.243 |
| 6Z90 Crystal structure of MINDY1 mutant-P138A 提交 2020-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–384（275 aa）
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突变：P138A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.7 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
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分辨率 3.59 Å R-free 0.258 |