当前蛋白身份：Q8NEZ4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2YSM Solution structure of the second and third PHD domain from Histone-lysine N-methyltransferase 2C (KMT2C/MLL3) 提交 2007-04-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
342–439（98 aa）
片段：PHD domain
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.94mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 0.05mM ZnCl2+1mM IDA; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2YUK Solution structure of the HMG box of human Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 3 homolog 提交 2007-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1631–1713（83 aa）
片段：HMG (high mobility group) box, UNP residues 1631-1713
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.11mM Protein; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3UVL Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of MLL3 提交 2011-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
4707–4717（11 aa）
片段：WDR5-interacting motif (UNP residues 4707-4717)
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突变：C4708S,S4711A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；323 K；0.1 M ammonium acetate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 4ERY X-ray structure of WDR5-MLL3 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
4703–4716（14 aa）
片段：UNP residues 4703-4716
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.5, hanging drop, temperature 294K
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分辨率 1.30 Å R-free 0.209 |
| 5F59 The crystal structure of MLL3 SET domain 提交 2015-12-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4757–4910（154 aa）
片段：MLL3 SET domain (UNP RESIDUES 4757-4910)
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris-HCl, pH8.5, 3M NaCl
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分辨率 2.80 Å R-free 0.229 |
| 5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
4757–4911（155 aa）
片段：UNP RESIDUES 4757-4911
链 E
4757–4911（155 aa）
片段：UNP RESIDUES 4757-4911
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2
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分辨率 2.41 Å R-free 0.228 |
| 5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
4757–4911（155 aa）
片段：UNP RESIDUES 4757-4911
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.228 |
| 5F6K Crystal structure of the MLL3-Ash2L-RbBP5 complex 提交 2015-12-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
4757–4911（155 aa）
片段：UNP RESIDUES 4757-4911
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 10% PEG 3350, 0.1 M MgCl2
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.228 |
| 6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 K
4707–4911（205 aa）
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突变：C4708S | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.00 Å |
| 6MLC PHD6 domain of MLL3 in complex with histone H4 提交 2018-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1055–1144（90 aa）
片段：PHD-type 7 zinc finger, residues 1055-1144
链 B
1055–1144（90 aa）
片段：PHD-type 7 zinc finger, residues 1055-1144
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未记录 | ZN ZINC ION × 42 GOL GLYCEROL × 6 UNX UNKNOWN LIGAND × 30 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2 M Na-Form, 0.1 M Tris, pH 8.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 6MLC PHD6 domain of MLL3 in complex with histone H4 提交 2018-09-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 C
1055–1144（90 aa）
片段：PHD-type 7 zinc finger, residues 1055-1144
链 D
1055–1144（90 aa）
片段：PHD-type 7 zinc finger, residues 1055-1144
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未记录 | ZN ZINC ION × 42 GOL GLYCEROL × 24 UNX UNKNOWN LIGAND × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2 M Na-Form, 0.1 M Tris, pH 8.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.216 |
| 7W6L The crystal structure of MLL3-RBBP5-ASH2L in complex with H3K4me0 peptide 提交 2021-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 C
4757–4911（155 aa）
链 E
4757–4911（155 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 10% polyethylene glycol 3350, 0.1 M MgCl2
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分辨率 2.26 Å R-free 0.223 |