当前蛋白身份:Q8NHM5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4O64 Zinc fingers of KDM2B 提交 2013-12-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 607–723(117 aa) 片段:UNP Residues 607-723
未记录 ZN ZINC ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop;pH 8.5;291 K;25% PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris, pH 8.5, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.13 Å R-free 0.220
4O64 Zinc fingers of KDM2B 提交 2013-12-20 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 607–723(117 aa) 片段:UNP Residues 607-723
未记录 ZN ZINC ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop;pH 8.5;291 K;25% PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris, pH 8.5, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.13 Å R-free 0.220
4O64 Zinc fingers of KDM2B 提交 2013-12-20 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 607–723(117 aa) 片段:UNP Residues 607-723
未记录 ZN ZINC ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 sitting drop;pH 8.5;291 K;25% PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris, pH 8.5, sitting drop, temperature 291K
分辨率 2.13 Å R-free 0.220
5JH5 Structural Basis for the Hierarchical Assembly of the Core of PRC1.1 提交 2016-04-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1059–1336(278 aa) 片段:RESIDUES 1059-1336
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.25;298 K;100 mM HEPES, 10 % 2-methyl-2,4-pentanediol, 10 mM NaCl
分辨率 2.55 Å R-free 0.257
6BVA Ubiquitin Variant (UbV.Fl10.1) bound to a human Skp1-Fbl10 fragment complex. 提交 2017-12-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 991–1035(45 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 18% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.66 Å R-free 0.263
6BVA Ubiquitin Variant (UbV.Fl10.1) bound to a human Skp1-Fbl10 fragment complex. 提交 2017-12-12 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 991–1035(45 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 18% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.66 Å R-free 0.263