当前蛋白身份:Q8NHM5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4O64 Zinc fingers of KDM2B 提交 2013-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
607–723(117 aa)
片段:UNP Residues 607-723
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop;pH 8.5;291 K;25% PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris, pH 8.5, sitting drop, temperature 291K
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分辨率 2.13 Å R-free 0.220 |
| 4O64 Zinc fingers of KDM2B 提交 2013-12-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
607–723(117 aa)
片段:UNP Residues 607-723
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop;pH 8.5;291 K;25% PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris, pH 8.5, sitting drop, temperature 291K
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.220 |
| 4O64 Zinc fingers of KDM2B 提交 2013-12-20 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
607–723(117 aa)
片段:UNP Residues 607-723
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop;pH 8.5;291 K;25% PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M tris, pH 8.5, sitting drop, temperature 291K
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.220 |
| 5JH5 Structural Basis for the Hierarchical Assembly of the Core of PRC1.1 提交 2016-04-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1059–1336(278 aa)
片段:RESIDUES 1059-1336
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.25;298 K;100 mM HEPES, 10 % 2-methyl-2,4-pentanediol, 10 mM NaCl
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分辨率 2.55 Å R-free 0.257 |
| 6BVA Ubiquitin Variant (UbV.Fl10.1) bound to a human Skp1-Fbl10 fragment complex. 提交 2017-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
991–1035(45 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 18% (w/v) PEG 6000
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分辨率 2.66 Å R-free 0.263 |
| 6BVA Ubiquitin Variant (UbV.Fl10.1) bound to a human Skp1-Fbl10 fragment complex. 提交 2017-12-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
991–1035(45 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 18% (w/v) PEG 6000
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分辨率 2.66 Å R-free 0.263 |