当前蛋白身份:Q8NI77 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3LRE Crystal Structure Analysis of Human Kinesin-8 Motor Domain 提交 2010-02-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–355(355 aa) 片段:UNP residues 1-355
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.8;275 K;10-13% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.8, 2% dioxane, vapor diffusion, temperature 275K
分辨率 2.20 Å R-free 0.277
3LRE Crystal Structure Analysis of Human Kinesin-8 Motor Domain 提交 2010-02-11 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–355(355 aa) 片段:UNP residues 1-355
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.8;275 K;10-13% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.8, 2% dioxane, vapor diffusion, temperature 275K
分辨率 2.20 Å R-free 0.277
3LRE Crystal Structure Analysis of Human Kinesin-8 Motor Domain 提交 2010-02-11 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–355(355 aa) 片段:UNP residues 1-355
链 B 1–355(355 aa) 片段:UNP residues 1-355
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.8;275 K;10-13% PEG 20000, 0.1M HEPES pH 7.8, 2% dioxane, vapor diffusion, temperature 275K
分辨率 2.20 Å R-free 0.277
5OAM Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition 提交 2017-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 K 1–374(374 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
5OCU Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition 提交 2017-07-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 K 1–374(374 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
5OGC Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition 提交 2017-07-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 K 1–374(374 aa)
未记录 9V5 4-chloranyl-2-nitro-1-(phenylsulfonyl)benzene × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7RSI The cryo-EM map of KIF18A bound to KIFBP 提交 2021-08-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–353(353 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
9DI0 Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule 提交 2024-09-04 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 2–374(373 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 TA1 TAXOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YMG Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin 提交 2025-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–367(367 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
分辨率 2.41 Å R-free 0.238
9YMG Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin 提交 2025-10-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 1–367(367 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
分辨率 2.41 Å R-free 0.238