当前蛋白身份：Q8TB45
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7DKL Crystal structure of the tandem DEP domains of DEPTOR 提交 2020-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
21–235（215 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Ammonium acetate, 24% PEG 3350
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分辨率 1.50 Å R-free 0.217 |
| 7OWG human DEPTOR in a complex with mutant human mTORC1 A1459P 提交 2021-06-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：Octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 O
1–409（409 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, 1 mM MgCl2, 500 uM AMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blotting time of 2 s and a force of -15.
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分辨率 4.70 Å |
| 7PE7 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, overall refinement 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 I
1–409（409 aa）
链 J
1–409（409 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 ACE ACETYL GROUP × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 7PE8 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7PE9 cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 2, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ACE ACETYL GROUP × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7PEA cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, overall refinement 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
1–409（409 aa）
链 J
1–409（409 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.07 Å |
| 7PEB cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, focussed on one protomer 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 7PEC cryo-EM structure of DEPTOR bound to human mTOR complex 1, DEPt-bound subset local refinement 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
1–409（409 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.24 Å |
| 7PED DEPTOR DEP domain tandem (DEPt) 提交 2021-08-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
链 B
1–230（230 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；PEG3350,natrium hydrochlorid
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分辨率 1.93 Å R-free 0.226 |