当前蛋白身份：Q8UN00
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2N3K Human Brd4 ET domain in complex with MLV Integrase C-term 提交 2015-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1719–1735（17 aa）
片段：MLV integrase C-terminal EBM (UNP residues 1719-1735)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.25；压力 ambient
NMR样品组成
0.4-0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Brd4 ET, 0.4-0.8 mM MLV IN EBM, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Brd4 ET, 0.4-0.8 mM MLV IN EBM, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.4-0.8 mM [U-99% 15N] Brd4 ET, 0.4-0.8 mM MLV IN EBM, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.4-0.8 mM [U-99% 15N] Brd4 ET, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM MLV IN EBM, 0.5 mM DSS, 0.002 v/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7JYZ Solution NMR structure and dynamics of human Brd3 ET in complex with MLV IN CTD 提交 2020-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1659–1738（80 aa）
片段：C-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Brd3 ET, 0.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MLV-IN-CTD, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.25 mM [U-15N] Brd3 ET, 0.25 mM [U-15N] MLV-IN-CTD, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7UYN Crystal structure of B-form alien DNA 5'-CTTBPPBBSSZZSAAG in a host-guest complex with the N-terminal fragment of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.05 M ADA, pH 6.5, 9% PEG4000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.246 |
| 7UYO Crystal structure of B-form alien DNA 5'-CTTSSPBZPSZBBAAG in a host-guest complex with the N-terminal fragment of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.05 M ADA, pH 6.5, 9% PEG4000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.257 |
| 7UYP Crystal structure of B-form alien DNA 5'-CTTZZPBSBSZPPAAG in a host-guest complex with the N-terminal fragment of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase 提交 2022-05-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.05 M ADA, pH 6.5, 9% PEG4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.234 |
| 8CS0 Crystal structure of alien DNA CTSZZPBSBSZPPBAG in a host-guest complex with the N-terminal fragment of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase 提交 2022-05-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.05 M ADA, pH 6.5, 9% PEG4000
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.243 |
| 8DW1 Crystal structure of a host-guest complex with 5'-CTTAGTTATAACTAAG-3' 提交 2022-07-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；5 mM magnesium acetate, 50 mM ADA, pH 6.5, 9% PEG4000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.238 |
| 8DW8 Host-guest structure of BLMA2 partially bound to 5'-ATTAGTTATAACTAAT-3' 提交 2022-07-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | BLM BLEOMYCIN A2 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals of the host-guest complex were obtained in 5 mM magnesium acetate, 50 mM ADA, pH 6.5, 9% PEG4000. To obtain complexes with BLM, crystals were soaked in well solutions containing 0.1 mM BLM followed by stabilization in 9% PEG4000, 5 mM magnesium acetate, 100 mM HEPES pH 8.0, 20% ethylene glycol, 0.25 mM BLM until unit cell changes correlating with binding of BLM were detected.
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.276 |
| 8DWM Host-guest complex of bleomycin A2 fully bound to CTTAGTTATAACTAAG 提交 2022-08-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
683–937（255 aa）
片段：N-terminal fragment (UNP residues 683-937)
|
未记录 | 3CO COBALT (III) ION × 2 BLM BLEOMYCIN A2 × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals of the host-guest complex were grown in 5 mM magnesium acetate, 0.05 M ADA pH 6.5, 9% PEG4000. To obtain complexes with BLM, crystals were soaked in well solutions containing 0.1 mM BLM followed by stabilization in 9% PEG4000, 5 mM magnesium acetate, 100 mM HEPES, pH 8.0, 20% ethylene glycol, 0.25 mM BLM until unit cell changes correlating with binding of BLM were detected.
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.297 |
| 8WUS SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (termination) 提交 2023-10-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 E
660–1155（496 aa）
|
突变：D200N, D209N, T306K, W313F, T330P, D335N | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8WUT SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (initiation) 提交 2023-10-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 E
660–1155（496 aa）
|
突变：D200N, D249N, T306K, W313F, T330P, D335N | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8WUV SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 16-nt) 提交 2023-10-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 E
660–1155（496 aa）
|
突变：D200N, D249N, T306K, W313F, T330P, D335N | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8YGJ SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 28-nt) 提交 2024-02-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 E
660–1155（496 aa）
|
突变：D200N, D209N, T306K, W313F, T330P, D335N | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |