当前蛋白身份：Q8VHW5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6QKC GluA1/2 In complex with auxiliary subunit gamma-8 提交 2019-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS, pH 8, 150 mM NaCl and 0.1 % digitonin (w/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3uL on grid, 60 sec incubation and 4sec blotting time
|
分辨率 4.40 Å |
| 6QKZ Full length GluA1/2-gamma8 complex 提交 2019-01-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS, pH 8, 150 mM NaCl and 0.1 % digitonin (w/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3uL on grid, 60 sec incubation and 4sec blotting time
|
分辨率 6.30 Å |
| 7OCA Resting state full-length GluA1/A2 heterotertramer in complex with TARP gamma 8 and CNIH2 提交 2021-04-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 46 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7OCD Resting state GluA1/A2 heterotetramer in complex with auxiliary subunit TARP gamma 8 (LBD-TMD) 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7OCE Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and CNIH2 (LBD-TMD) 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 46 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7OCF Active state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and CNIH2 (LBD-TMD) 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 26 GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7QHB Active state of GluA1/2 in complex with TARP gamma 8, L-glutamate and CTZ 提交 2021-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | PAM PALMITOLEIC ACID × 14 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 79N (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-hexadec-7-enoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS
150 mM NaCl
0.02 % GDN
87 uM CTZ
100 mM L-Glu
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3-4 second blots
|
分辨率 3.50 Å |
| 7QHH Desensitized state of GluA1/2 AMPA receptor in complex with TARP-gamma 8 (TMD-LBD) 提交 2021-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 PAM PALMITOLEIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 79N (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-hexadec-7-enoate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS
150 mM NaCl
0.02 % GDN
87 uM CTZ
100 mM L-Glu
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3-4 second blots
|
分辨率 3.60 Å |
| 8AYL Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand JNJ-61432059 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PLM PALMITIC ACID × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 OIJ 5-[2-(4-fluorophenyl)-7-(4-oxidanylpiperidin-1-yl)pyrazolo[1,5-c]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydroindol-2-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8AYM Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand JNJ-55511118 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 PLM PALMITIC ACID × 14 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8AYN Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand LY3130481 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PLM PALMITIC ACID × 14 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 OLR 6-[(1~{S})-1-[1-[5-(2-hydroxyethyloxy)pyridin-2-yl]pyrazol-3-yl]ethyl]-3~{H}-1,3-benzothiazol-2-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8AYO Open state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand JNJ-61432059 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 I
2–417（416 aa）
链 J
2–417（416 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PLM PALMITIC ACID × 10 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 2 OIJ 5-[2-(4-fluorophenyl)-7-(4-oxidanylpiperidin-1-yl)pyrazolo[1,5-c]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydroindol-2-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |