当前蛋白身份:Q8VSD5
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3B21 Crystal structure of OspI from Shigella flexineri 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES, 0.1M NaAcetate, 1.0M NaCl, 24%(w/v) PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.226 |
| 3W30 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
|
突变:C62A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M Magnesium Acetate, 0.1M Tris-HCl (pH6.5), 25% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.303 |
| 3W30 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–212(212 aa)
|
突变:C62A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M Magnesium Acetate, 0.1M Tris-HCl (pH6.5), 25% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.303 |
| 3W31 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
|
突变:C62A | IOD IODIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.4M potassium iodide, 0.1M MES (pH6.5), 4mM DTT, 15% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.284 |
| 4IP3 Complex structure of OspI and Ubc13 提交 2013-01-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
|
突变:C62A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;298 K;0.2 M Sodium thiocyanate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 4XZX Shigella flexneri effector OspI C62S mutant 提交 2015-02-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–212(212 aa)
|
突变:C62S | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.2M magnesium acetate, 0.1M sodium cacodylate, 20% PEG8000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.246 |