当前蛋白身份:Q8VSD5 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3B21 Crystal structure of OspI from Shigella flexineri 提交 2011-07-19 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES, 0.1M NaAcetate, 1.0M NaCl, 24%(w/v) PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.01 Å R-free 0.226
3W30 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
突变:C62A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M Magnesium Acetate, 0.1M Tris-HCl (pH6.5), 25% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.99 Å R-free 0.303
3W30 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–212(212 aa)
突变:C62A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M Magnesium Acetate, 0.1M Tris-HCl (pH6.5), 25% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.99 Å R-free 0.303
3W31 Structual basis for the recognition of Ubc13 by the Shigella flexneri effector OspI 提交 2012-12-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
突变:C62A IOD IODIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.4M potassium iodide, 0.1M MES (pH6.5), 4mM DTT, 15% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.96 Å R-free 0.284
4IP3 Complex structure of OspI and Ubc13 提交 2013-01-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
突变:C62A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;298 K;0.2 M Sodium thiocyanate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.248
4XZX Shigella flexneri effector OspI C62S mutant 提交 2015-02-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–212(212 aa)
突变:C62S ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.2M magnesium acetate, 0.1M sodium cacodylate, 20% PEG8000
分辨率 2.20 Å R-free 0.246