当前蛋白身份：Q8WR62
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5II4 Crystal structure of red abalone VERL repeat 1 with linker at 2.0 A resolution 提交 2016-03-01 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–175（138 aa）
|
突变：N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；40% PEG 600, 0.1M CHES
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.247 |
| 5II5 Crystal structure of red abalone VERL repeat 1 at 1.8 A resolution 提交 2016-03-01 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–151（114 aa）
|
突变：N4115Q, N4122T, N4142Y,N4115Q, N4122T, N4142Y,N4115Q, N4122T, N4142Y,N4115Q, N4122T, N4142Y | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；40% PEG 600, 0.1M CHES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.233 |
| 5IIA Crystal structure of red abalone egg VERL repeat 3 in complex with sperm lysin at 1.7 A resolution (crystal form I) 提交 2016-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
340–453（114 aa）
片段：UNP residues 340-453
链 D
340–453（114 aa）
片段：UNP residues 340-453
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M di-ammonium citrate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
| 5IIA Crystal structure of red abalone egg VERL repeat 3 in complex with sperm lysin at 1.7 A resolution (crystal form I) 提交 2016-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
340–453（114 aa）
片段：UNP residues 340-453
链 H
340–453（114 aa）
片段：UNP residues 340-453
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M di-ammonium citrate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
| 5IIB Crystal structure of red abalone egg VERL repeat 3 in complex with sperm lysin at 1.64 A resolution (crystal form II) 提交 2016-03-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
340–453（114 aa）
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未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M citric acid
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分辨率 1.64 Å R-free 0.205 |
| 5IIC Crystal structure of red abalone VERL repeat 3 at 2.9 A resolution 提交 2016-03-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
340–453（114 aa）
链 B
340–453（114 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M tri-sodium citrate
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分辨率 2.90 Å R-free 0.310 |
| 5MR2 Crystal structure of red abalone VERL repeat 2 with linker at 2.5 A resolution 提交 2016-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
176–298（123 aa）
片段：UNP residues 176-298
|
突变：S293A, S296A, S297A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；0.2 M ammonium formate pH 6.6, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.280 |
| 5MR2 Crystal structure of red abalone VERL repeat 2 with linker at 2.5 A resolution 提交 2016-12-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
176–298（123 aa）
片段：UNP residues 176-298
链 B
176–298（123 aa）
片段：UNP residues 176-298
|
突变：S293A, S296A, S297A 突变：S293A, S296A, S297A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；293 K；0.2 M ammonium formate pH 6.6, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.280 |
| 5MR3 Crystal structure of red abalone egg VERL repeat 2 with linker in complex with sperm lysin at 1.8 A resolution 提交 2016-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
176–298（123 aa）
链 D
176–298（123 aa）
|
突变：S293A, S296A, S297A 突变：S293A, S296A, S297A | GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；5% (w/v) PEG 8000, 20% (v/v) PEG 300, 10% (v/v) Glycerol, 0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.227 |
| 5MR3 Crystal structure of red abalone egg VERL repeat 2 with linker in complex with sperm lysin at 1.8 A resolution 提交 2016-12-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
176–298（123 aa）
链 H
176–298（123 aa）
|
突变：S293A, S296A, S297A 突变：S293A, S296A, S297A | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；5% (w/v) PEG 8000, 20% (v/v) PEG 300, 10% (v/v) Glycerol, 0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.227 |