当前蛋白身份：Q8WZA1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5GGF Crystal structure of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase form II 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–660（569 aa）
片段：UNP residues 92-660
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.4-1.6M Na malonate
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.253 |
| 5GGF Crystal structure of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase form II 提交 2016-06-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–660（569 aa）
片段：UNP residues 92-660
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.4-1.6M Na malonate
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.253 |
| 5GGF Crystal structure of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase form II 提交 2016-06-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
92–660（569 aa）
片段：UNP residues 92-660
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.4-1.6M Na malonate
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.253 |
| 5GGG Crystal structure of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase form I 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–660（569 aa）
片段：UNP residues 92-660
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；Na malonate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.241 |
| 5GGI Crystal structure of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Mn, UDP and Mannosyl-peptide 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–660（569 aa）
片段：UNP residues 92-660
|
未记录 | UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；NaKPO4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.238 |
| 5GGI Crystal structure of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Mn, UDP and Mannosyl-peptide 提交 2016-06-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
92–660（569 aa）
片段：UNP residues 92-660
|
未记录 | UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；NaKPO4
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.238 |
| 5GGJ Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Man-alpha-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | PNA 4-nitrophenyl alpha-D-mannopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-6000
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.209 |
| 5GGJ Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Man-alpha-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | PNA 4-nitrophenyl alpha-D-mannopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-6000
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.209 |
| 5GGK Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Man-beta-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | MBE 4-nitrophenyl beta-D-mannopyranoside × 1 GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl, PEG-10000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.175 |
| 5GGK Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Man-beta-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | MBE 4-nitrophenyl beta-D-mannopyranoside × 1 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl, PEG-10000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.175 |
| 5GGL Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-alpha-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | 6ZC 4-nitrophenyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-8000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.161 |
| 5GGL Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-alpha-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | 6ZC 4-nitrophenyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-8000
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.161 |
| 5GGN Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | LEC 4-nitrophenyl 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-6000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.166 |
| 5GGN Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | LEC 4-nitrophenyl 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-6000
|
分辨率 1.21 Å R-free 0.166 |
| 5GGO Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GalNac-beta1,3-GlcNAc-beta-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 97-250
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 5GGO Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GalNac-beta1,3-GlcNAc-beta-pNP 提交 2016-06-16 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 97-250
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293 K；Tris-HCl, PEG-6000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 5GGP Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta1,2-Man-peptide 提交 2016-06-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；MES-NaOH, LiCl2, Na acetate, PEG-6000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.246 |
| 5GGP Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with GlcNAc-beta1,2-Man-peptide 提交 2016-06-16 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
未记录 | NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；MES-NaOH, LiCl2, Na acetate, PEG-6000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.246 |
| 5XFC Serial femtosecond X-ray structure of a stem domain of human O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase solved by Se-SAD using XFEL (refined against 13,000 patterns) 提交 2017-04-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MBE 4-nitrophenyl beta-D-mannopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7；293 K；HEPES-NaOH, PEG4000
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分辨率 1.40 Å R-free 0.207 |
| 5XFC Serial femtosecond X-ray structure of a stem domain of human O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase solved by Se-SAD using XFEL (refined against 13,000 patterns) 提交 2017-04-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
92–250（159 aa）
片段：UNP residues 92-250
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MBE 4-nitrophenyl beta-D-mannopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7；293 K；HEPES-NaOH, PEG4000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.207 |