当前蛋白身份:Q8ZL64 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2WPQ Salmonella enterica SadA 479-519 fused to GCN4 adaptors (SadAK3, in- register fusion) 提交 2009-08-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 479–519(41 aa) 片段:RESIDUES 479-519 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
链 B 479–519(41 aa) 片段:RESIDUES 479-519 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
链 C 479–519(41 aa) 片段:RESIDUES 479-519 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
未记录 NO3 NITRATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 20% (W/V) PEG 3350, 0.2 M KNO3
分辨率 1.85 Å R-free 0.288
2WPR Salmonella enterica SadA 483-523 fused to GCN4 adaptors (SadAK3b-V1, out-of-register fusion) 提交 2009-08-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 483–523(41 aa) 片段:RESIDUES 483-523 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
链 B 483–523(41 aa) 片段:RESIDUES 483-523 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
链 C 483–523(41 aa) 片段:RESIDUES 483-523 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% (W/V) PEG 4000, 10% (V/V) ISOPOPANOL, 3% (W/V) 1,5-DIAMINOPENTANE DIHYDROCHLORIDE, 100 MM NA-CITRATE PH 5.6
分辨率 2.65 Å R-free 0.327
2WPS Salmonella enterica SadA 483-523 fused to GCN4 adaptors (SadAK3b-V2, out-of-register fusion) 提交 2009-08-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 483–523(41 aa) 片段:RESIDUES 483-523 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
链 B 483–523(41 aa) 片段:RESIDUES 483-523 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
链 C 483–523(41 aa) 片段:RESIDUES 483-523 FUSED TO GCN4 ADAPTORS
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% (W/V) PEG 4000, 10% (V/V) ISOPOPANOL, 3% (W/V) 1,5-DIAMINOPENTANE DIHYDROCHLORIDE, 100 MM NA-CITRATE PH 5.6
分辨率 2.60 Å R-free 0.324
2YNY Salmonella enterica SadA 255-302 fused to GCN4 adaptors (SadAK1) 提交 2012-10-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 255–302(48 aa) 片段:GCN4 AT EITHER END, RESIDUES 250-278. ADHESIN, RESIDUES 255-302
链 B 255–302(48 aa) 片段:GCN4 AT EITHER END, RESIDUES 250-278. ADHESIN, RESIDUES 255-302
链 C 255–302(48 aa) 片段:GCN4 AT EITHER END, RESIDUES 250-278. ADHESIN, RESIDUES 255-302
突变:YES 突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16% (W/V) PEG 4000, 80 MM SODIUM ACETATE, 100 MM HEPES PH 7.5
分辨率 1.35 Å R-free 0.198
2YNZ Salmonella enterica SadA 823-947 fused to a GCN4 adaptor (SadAK5) 提交 2012-10-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 823–947(125 aa) 片段:GCN ADAPTOR RESIDUES, 250-278, ADHESIN RESIDUES 823-947
链 B 823–947(125 aa) 片段:GCN ADAPTOR RESIDUES, 250-278, ADHESIN RESIDUES 823-947
链 C 823–947(125 aa) 片段:GCN ADAPTOR RESIDUES, 250-278, ADHESIN RESIDUES 823-947
突变:YES 突变:YES 突变:YES NO3 NITRATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 10% (W/V) PEG 10000, 200 MM MAGNESIUM NITRATE
分辨率 1.40 Å R-free 0.232
2YO0 Salmonella enterica SadA 1049-1304 fused to GCN4 adaptors (SadAK9-cfI) 提交 2012-10-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1049–1304(256 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR, RESIDUES 250-278, ADHESIN, RESIDUES 1049-1304
突变:YES CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 20% (V/V) BUTANEDIOL, 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.297
2YO1 Salmonella enterica SadA 1049-1304 fused to GCN4 adaptors (SadAK9- cfII) 提交 2012-10-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1049–1304(256 aa) 片段:RESIDUES 1049-1304 FUSED TO GCN4 ADAPTORS, RESIDUES 250-278
链 B 1049–1304(256 aa) 片段:RESIDUES 1049-1304 FUSED TO GCN4 ADAPTORS, RESIDUES 250-278
链 C 1049–1304(256 aa) 片段:RESIDUES 1049-1304 FUSED TO GCN4 ADAPTORS, RESIDUES 250-278
突变:YES 突变:YES 突变:YES CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 15 % (V/V) BUTANEDIOL, 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.2
分辨率 3.10 Å R-free 0.320
2YO2 Salmonella enterica SadA 255-358 fused to GCN4 adaptors (SadAK12) 提交 2012-10-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 255–358(104 aa) 片段:RESIDUES 255-358 FUSED TO GCN4 ADAPTORS AT EITHER END, RESIDUES 250-278
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 500 MM AMMONIUM TARTRATE, 100 MM SODIUM ACETATE PH 5.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.284
2YO3 Salmonella enterica SadA 1185-1386 fused to GCN4 adaptors (SadAK14) 提交 2012-10-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1185–1386(202 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278, ADHESIN RESIDUES 1185-1386, GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278
链 B 1185–1386(202 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278, ADHESIN RESIDUES 1185-1386, GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278
链 C 1185–1386(202 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278, ADHESIN RESIDUES 1185-1386, GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278
突变:YES 突变:YES 突变:YES CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 12% (W/V) PEG 8000, 100 MM MAGNESIUM ACETATE, 100 MM TRIS PH 8.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
3ZMF Salmonella enterica SadA 303-358 fused to GCN4 adaptors (SadAK2) 提交 2013-02-08 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 303–358(56 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278, ADHESIN RESIDUES 303-358, GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 50% PEG 200, 0.1 M NA-CITRATE PH 5.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.221
3ZMF Salmonella enterica SadA 303-358 fused to GCN4 adaptors (SadAK2) 提交 2013-02-08 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 303–358(56 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278, ADHESIN RESIDUES 303-358, GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 50% PEG 200, 0.1 M NA-CITRATE PH 5.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.221
3ZMF Salmonella enterica SadA 303-358 fused to GCN4 adaptors (SadAK2) 提交 2013-02-08 Assembly 3 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 303–358(56 aa) 片段:GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278, ADHESIN RESIDUES 303-358, GCN4 ADAPTOR RESIDUES 250-278
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 50% PEG 200, 0.1 M NA-CITRATE PH 5.5
分辨率 1.85 Å R-free 0.221