当前蛋白身份:Q91132
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3FRP Crystal Structure of Cobra Venom Factor, a Co-factor for C3- and C5 convertase CVFBb 提交 2009-01-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
23–649(627 aa)
链 B
1264–1642(379 aa)
链 G
733–984(252 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;293 K;13% PEG 3350, 10 mM MES pH 6.8, 5 mM CaCl2, 200 mM NH4Cl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.297 |
| 3HRZ Cobra Venom Factor (CVF) in complex with human factor B 提交 2009-06-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
23–649(627 aa)
片段:residues 23-649
链 B
733–984(252 aa)
片段:residues 733-984
链 C
1264–1642(379 aa)
片段:residues 1264-1642
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;291 K;PEG 3350, PEG 400, Na/K Phosphate, Bis-Tris propane, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.226 |
| 3HS0 Cobra Venom Factor (CVF) in complex with human factor B 提交 2009-06-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 F
23–649(627 aa)
片段:residues 23-649
链 G
733–984(252 aa)
片段:residues 733-984
链 H
1264–1642(379 aa)
片段:residues 1264-1642
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;291 K;PEG 1500, 2,3 butanediol, malic acid 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid tris (hydroxymethyl)aminomethane buffer (MMT), pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.243 |
| 3HS0 Cobra Venom Factor (CVF) in complex with human factor B 提交 2009-06-10 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
23–649(627 aa)
片段:residues 23-649
链 B
733–984(252 aa)
片段:residues 733-984
链 C
1264–1642(379 aa)
片段:residues 1264-1642
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;291 K;PEG 1500, 2,3 butanediol, malic acid 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid tris (hydroxymethyl)aminomethane buffer (MMT), pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.243 |
| 3HS0 Cobra Venom Factor (CVF) in complex with human factor B 提交 2009-06-10 | Assembly 3 其他组合 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 A
23–649(627 aa)
片段:residues 23-649
链 B
733–984(252 aa)
片段:residues 733-984
链 C
1264–1642(379 aa)
片段:residues 1264-1642
链 F
23–649(627 aa)
片段:residues 23-649
链 G
733–984(252 aa)
片段:residues 733-984
链 H
1264–1642(379 aa)
片段:residues 1264-1642
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;291 K;PEG 1500, 2,3 butanediol, malic acid 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid tris (hydroxymethyl)aminomethane buffer (MMT), pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.243 |
| 3PRX Structure of Complement C5 in Complex with CVF and SSL7 提交 2010-11-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–1642(1642 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;292 K;3 M sodium malonate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.261 |
| 3PRX Structure of Complement C5 in Complex with CVF and SSL7 提交 2010-11-30 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
1–1642(1642 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;292 K;3 M sodium malonate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.261 |
| 3PVM Structure of Complement C5 in Complex with CVF 提交 2010-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–1642(1642 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.30 Å R-free 0.262 |
| 3PVM Structure of Complement C5 in Complex with CVF 提交 2010-12-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
1–1642(1642 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.30 Å R-free 0.262 |
| 8AYH Structure of Complement C5 in Complex with small molecule inhibitor and CVF 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
1–1642(1642 aa)
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未记录 | H1H 5-methoxy-2-[[(1~{S})-1-(2-methoxyphenyl)ethyl]carbamoylamino]-4-(4-methylpentoxy)benzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50mM HEPES pH 7.5
100mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.35 Å |