当前蛋白身份:Q92130 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3KUY DNA Stretching in the Nucleosome Facilitates Alkylation by an Intercalating Antitumor Agent 提交 2009-11-28 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 D 2–126(125 aa)
链 H 2–126(125 aa)
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 ATV 2-[(2R)-oxiran-2-ylmethyl]-1H-benzo[de]isoquinoline-1,3(2H)-dione × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6;291 K;85 mM MnCl2, 60 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate, 4 mg/ml NCP over well with 1/2 conc., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, EVAPORATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.286
6VZ4 Cryo-EM structure of Sth1-Arp7-Arp9-Rtt102 bound to the nucleosome in ADP Beryllium Fluoride state 提交 2020-02-27 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 D 1–125(125 aa)
链 H 1–125(125 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;4 second blot time, blot force 20
分辨率 3.90 Å