当前蛋白身份：Q92633
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4Z34 Crystal Structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1 in complex with ONO9780307 提交 2015-03-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–232（231 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 73-127; unp residues 248-326
链 A
248–326（79 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 73-127; unp residues 248-326
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | ON7 {1-[(2S,3S)-2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylmethyl)-3-(3,5-dimethoxy-4-methylphenyl)-3-hydroxypropyl]-4-(methoxycarbonyl)-1 H-pyrrol-3-yl}acetic acid × 1 1WV (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-tetradec-7-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium citrate (pH 5.5),
34 - 38% (v/v) PEG400 and
200 mM ammonium acetate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.281 |
| 4Z35 Crystal Structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1 in complex with ONO-9910539 提交 2015-03-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–232（231 aa）
链 A
248–326（79 aa）
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | ON9 3-{1-[(2S,3S)-3-(4-acetyl-3,5-dimethoxyphenyl)-2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylmethyl)-3-hydroxypropyl]-4-(methoxycarbonyl)-1H-pyrrol-3-yl}propanoic acid × 1 1WV (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-tetradec-7-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium citrate
(pH 5.5), 34 - 38% (v/v) PEG400 and 200 mM ammonium acetate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.279 |
| 4Z36 Crystal Structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1 in complex with ONO-3080573 提交 2015-03-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–232（231 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 78-127; unp residues 249-327
链 A
249–327（79 aa）
片段：unp residues 2-232; unp residues 23-64; unp residues 78-127; unp residues 249-327
|
突变：M1007W, H1102I, R1106L 突变：M1007W, H1102I, R1106L | ON3 1-(4-{[(2S,3R)-2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-yloxy)-3-(3,5-dimethoxy-4-methylphenyl)-3-hydroxypropyl]oxy}phenyl)cyclopropan ecarboxylic acid × 1 1WV (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-tetradec-7-enoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；0.1 M sodium citrate
(pH 5.5), 34 - 38% (v/v) PEG400 and 200 mM ammonium acetate
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.292 |
| 7TD0 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA 提交 2021-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–340（339 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7TD1 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA, state a 提交 2021-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–340（339 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 7TD2 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA, state a 提交 2021-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–340（339 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 7YU3 Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to ONO-0740556 提交 2022-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | K6L [(2~{R})-2-[5-(2-hexylphenyl)pentanoylamino]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7YU4 Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to ONO-0740556, focused on receptor 提交 2022-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–364（363 aa）
|
未记录 | K6L [(2~{R})-2-[5-(2-hexylphenyl)pentanoylamino]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7YU5 Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to ONO-0740556, state1 提交 2022-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | K6L [(2~{R})-2-[5-(2-hexylphenyl)pentanoylamino]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7YU6 Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to ONO-0740556, state2 提交 2022-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | K6L [(2~{R})-2-[5-(2-hexylphenyl)pentanoylamino]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7YU7 Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to ONO-0740556, state3 提交 2022-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | K6L [(2~{R})-2-[5-(2-hexylphenyl)pentanoylamino]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7YU8 Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to ONO-0740556, state4 提交 2022-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | K6L [(2~{R})-2-[5-(2-hexylphenyl)pentanoylamino]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.60 Å |
| 9IZF Cryo-EM structure of LPA1-Gi complex with LPA 提交 2024-08-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 9IZG Cryo-EM structure of LPA1-Gq complex with LPA 提交 2024-08-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9IZH Cryo-EM structure of LPA1-G13 complex with LPA 提交 2024-08-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9J5V Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1-Gi complex bound to CpY 提交 2024-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
2–364（363 aa）
|
未记录 | A1L3Q CpY × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |