当前蛋白身份：Q92673
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2DM4 Solution structure of the second fn3 domain of human sorLA/LR11 提交 2006-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1651–1745（95 aa）
片段：FN3
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.18mM uniformly 13C and 15N labeled protein; 20mM TrisHCl, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.02% NaN3; 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
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分辨率未提供 |
| 3G2S VHS Domain of human GGA1 complexed with SorLA C-terminal Peptide 提交 2009-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2202–2214（13 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；15%(w/v) PEG 5000 mmE, 0.2M NH4I, 0.3M 1,6-hexanediol, 0.1M MES-NaOH, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 3G2S VHS Domain of human GGA1 complexed with SorLA C-terminal Peptide 提交 2009-02-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2202–2214（13 aa）
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未记录 | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；15%(w/v) PEG 5000 mmE, 0.2M NH4I, 0.3M 1,6-hexanediol, 0.1M MES-NaOH, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.226 |
| 3G2T VHS Domain of human GGA1 complexed with SorLA C-terminal Phosphopeptide 提交 2009-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2202–2214（13 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；18%(w/v) PEG 5000 MME, 0.2M NH4I, 0.1M TRIS-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 3G2T VHS Domain of human GGA1 complexed with SorLA C-terminal Phosphopeptide 提交 2009-02-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2202–2214（13 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；18%(w/v) PEG 5000 MME, 0.2M NH4I, 0.1M TRIS-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 3WSX SorLA Vps10p domain in ligand-free form 提交 2014-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–753（725 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 29-753
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M Sodium Acetate, 1.2M Sodium dihydrogen phosphate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.35 Å R-free 0.238 |
| 3WSY SorLA Vps10p domain in complex with its own propeptide fragment 提交 2014-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–753（668 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 86-753
链 C
42–56（15 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Cacodylate, 1.2M Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.11 Å R-free 0.232 |
| 3WSZ SorLA Vps10p domain in complex with Abeta-derived peptide 提交 2014-03-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–753（668 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 86-753
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；0.1M Tris, 1.41M Sodium Acetate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 3.20 Å R-free 0.296 |
| 7VT0 Dimer structure of SORLA 提交 2021-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
89–752（664 aa）
链 B
89–752（664 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 OTHER
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分辨率 3.40 Å |