当前蛋白身份：Q92730
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2CLS The crystal structure of the human RND1 GTPase in the active GTP bound state 提交 2006-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5–200（196 aa）
片段：RESIDUES 5-200
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.2M NAI, 20%(W/V)PEG3350, 0.1M BISTRISPROPANE PH8.5, 10% (V/V) ETHYLENE GLYCOL, 0.5% (V/V) DIMETHYLSULPHOXIDE, pH 8.50
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.236 |
| 2CLS The crystal structure of the human RND1 GTPase in the active GTP bound state 提交 2006-04-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5–200（196 aa）
片段：RESIDUES 5-200
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.2M NAI, 20%(W/V)PEG3350, 0.1M BISTRISPROPANE PH8.5, 10% (V/V) ETHYLENE GLYCOL, 0.5% (V/V) DIMETHYLSULPHOXIDE, pH 8.50
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.236 |
| 2REX Crystal structure of the effector domain of PLXNB1 bound with Rnd1 GTPase 提交 2007-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 15 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 2REX Crystal structure of the effector domain of PLXNB1 bound with Rnd1 GTPase 提交 2007-09-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 15 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 2REX Crystal structure of the effector domain of PLXNB1 bound with Rnd1 GTPase 提交 2007-09-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
链 D
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 30 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 2REX Crystal structure of the effector domain of PLXNB1 bound with Rnd1 GTPase 提交 2007-09-27 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
链 D
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 60 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 2REX Crystal structure of the effector domain of PLXNB1 bound with Rnd1 GTPase 提交 2007-09-27 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
链 D
5–200（196 aa）
片段：Residues 5-200
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 30 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 3Q3J Crystal structure of plexin A2 RBD in complex with Rnd1 提交 2010-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
5–200（196 aa）
片段：UNP residues 5-200
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 36 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
vapor diffusion, sitting drops；pH 7.5；293 K；The complex sample (2.7 mg/mL) was incubated with 5mM Gpp(NH)p. Crystallization cocktail: 25.5% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.1M Hepes. Seeding was applied in the production of the diffraction-quality crystal., pH 7.5, vapor diffusion, sitting drops, temperature 293K
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分辨率 1.97 Å R-free 0.248 |