当前蛋白身份：Q92797
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3O2Q Crystal structure of the human symplekin-Ssu72-CTD phosphopeptide complex 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 3O2Q Crystal structure of the human symplekin-Ssu72-CTD phosphopeptide complex 提交 2010-07-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 3O2S Crystal structure of the human symplekin-Ssu72 complex 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.32M ammonium sulfate, 26% (w/v) PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 3O2T Crystal structure of the N-terminal domain of human Symplekin 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–395（366 aa）
片段：N-terminal domain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50mM Bis-Tris, 40mM ammonium sulfate, 40% (v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.192 |
| 3ODR Crystal Structure of the N-terminal Domain of Human Symplekin 提交 2010-08-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
片段：N-terminal domain
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50MM BIS-TRIS, 40MM AMMONIUM SULFATE, 40% (V/V) PENTAERYTHRITOL ETHOXYLATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.229 |
| 3ODS Crystal structure of the K185A mutant of the N-terminal domain of human Symplekin 提交 2010-08-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：K185A | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50MM BIS-TRIS, 40MM AMMONIUM SULFATE, 40% (V/V) PENTAERYTHRITOL ETHOXYLATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 4H3H Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA poymerase II CTD peptide phosphorylated at SER-7 提交 2012-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 4H3H Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA poymerase II CTD peptide phosphorylated at SER-7 提交 2012-09-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 4H3H Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA poymerase II CTD peptide phosphorylated at SER-7 提交 2012-09-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 4H3H Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA poymerase II CTD peptide phosphorylated at SER-7 提交 2012-09-13 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate,, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 4H3K Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA polymerase II CTD peptide phosphorylated at Ser-2, Ser-5 and Ser-7 提交 2012-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 4H3K Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA polymerase II CTD peptide phosphorylated at Ser-2, Ser-5 and Ser-7 提交 2012-09-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 4H3K Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA polymerase II CTD peptide phosphorylated at Ser-2, Ser-5 and Ser-7 提交 2012-09-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 4H3K Crystal structure of a ternary complex of human symplekin NTD, human Ssu72 and a RNA polymerase II CTD peptide phosphorylated at Ser-2, Ser-5 and Ser-7 提交 2012-09-13 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
30–360（331 aa）
片段：N-terminal domain, UNP residues 30-360
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.6M ammonium chloride, 27% (w/v) PEG 3350, 10mM Sodium potassium tartrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 6V4X Cryo-EM structure of an active human histone pre-mRNA 3'-end processing machinery at 3.2 Angstrom resolution 提交 2019-12-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 J
30–1101（1072 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9N96 CRYO-EM STRUCTURE OF human U7 SM RING IN COMPLEX WITH SYMPLEKIN N-TERMINAL DOMAIN 提交 2025-02-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 J
30–1101（1072 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9NB1 CRYO-EM STRUCTURE OF human U7 SNRNP WITH MUTANT LSM11 that disrupts contacts with CPSF73 提交 2025-02-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
30–1101（1072 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.85 Å |
| 9NGO CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN U7 SNRNP WITH METHYLATED noncleavable H2A* SUBSTRATE PRE-MRNA (FOCUS MAP) 提交 2025-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
30–1101（1072 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9NH5 CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN U7 SNRNP WITH METHYLATED noncleavable H2A* SUBSTRATE PRE-MRNA (core region) 提交 2025-02-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
30–1101（1072 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 9NH6 CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN U7 SNRNP WITH METHYLATED noncleavable H2A* SUBSTRATE PRE-MRNA (COMPOSITE MAP) 提交 2025-02-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 J
30–1101（1072 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |