当前蛋白身份：Q96AE4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1J4W COMPLEX OF THE KH3 and KH4 DOMAINS OF FBP WITH A SINGLE_STRANDED 29mer DNA OLIGONUCLEOTIDE FROM THE FUSE ELEMENT OF THE C-MYC ONCOGENE 提交 2001-11-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
278–447（170 aa）
片段：RESIDUES 278-447, NUMBERERED 5-174. KH3 AND KH4 DOMAINS.
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突变：C59A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM SODIUM PHOSPHATE
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分辨率未提供 |
| 2KXH Solution structure of the first two RRM domains of FIR in the complex with FBP Nbox peptide 提交 2010-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
27–52（26 aa）
片段：UNP residues 27-52
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.06；压力 ambient
NMR测量条件
pH 8；318 K；离子强度（mmCIF原始值）0.06；压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM [U-15N] protein_1-1, 10 mM TRIS-HCl pH 8.0-2, 50 mM sodium chloride-3, 2 mM TCEP-4, 1.25 mM protein_2-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
mM [U-13C; U-15N] protein_1-6, 10 mM TRIS-HCl pH 8.0-7, 50 mM sodium chloride-8, 2 mM TCEP-9, mM protein_2-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.3 mM [U-13C; U-15N] protein_2-11, 10 mM TRIS-HCl pH 8.0-12, 50 mM sodium chloride-13, 2 mM TCEP-14, mM protein_1-15, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
mM [U-13C; U-15N] protein_1-16, 10 mM TRIS-HCl pH 8.0-17, 50 mM sodium chloride-18, 2 mM TCEP-19, mM protein_2-20, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4LIJ Crystal structure of a far upstream element (FUSE) binding protein 1 (FUBP1) from Homo sapiens at 1.95 A resolution 提交 2013-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
86–174（89 aa）
片段：UNP residues 86-174
链 B
86–174（89 aa）
片段：UNP residues 86-174
链 C
86–174（89 aa）
片段：UNP residues 86-174
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20.00% Glycerol, 1.60M ammonium dihydrogen phosphate, 0.1M TRIS pH 8.5, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 4LIJ Crystal structure of a far upstream element (FUSE) binding protein 1 (FUBP1) from Homo sapiens at 1.95 A resolution 提交 2013-07-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
86–174（89 aa）
片段：UNP residues 86-174
链 B
86–174（89 aa）
片段：UNP residues 86-174
链 C
86–174（89 aa）
片段：UNP residues 86-174
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20.00% Glycerol, 1.60M ammonium dihydrogen phosphate, 0.1M TRIS pH 8.5, NANODROP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 6Y24 Crystal structure of fourth KH domain of FUBP1 提交 2020-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
365–455（91 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3.1 M sodium formate
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分辨率 1.86 Å R-free 0.243 |
| 6Y2C Crystal structure of the third KH domain of FUBP1 提交 2020-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
260–350（91 aa）
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 6000, 10% ethylene glycol, 0.015M Zinkchlorid, 0.1 M MES, pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 6Y2C Crystal structure of the third KH domain of FUBP1 提交 2020-02-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
260–350（91 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 6000, 10% ethylene glycol, 0.015M Zinkchlorid, 0.1 M MES, pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 6Y2D Crystal structure of the second KH domain of FUBP1 提交 2020-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
185–259（75 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate, 5% 2-propanol, 2.5% Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 6Y2D Crystal structure of the second KH domain of FUBP1 提交 2020-02-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
185–259（75 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate, 5% 2-propanol, 2.5% Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 6Y2D Crystal structure of the second KH domain of FUBP1 提交 2020-02-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
185–259（75 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate, 5% 2-propanol, 2.5% Glycerol
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 6Y2D Crystal structure of the second KH domain of FUBP1 提交 2020-02-15 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
185–259（75 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate, 5% 2-propanol, 2.5% Glycerol
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分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 8P25 Solution structure of a chimeric U2AF2 RRM2 / FUBP1 N-Box 提交 2023-05-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
21–56（36 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Chimeric construct of U2AF2 linker-RRM2 and FUBP1 N-box, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Chimeric construct of U2AF2 linker-RRM2 and FUBP1 N-box, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |