当前蛋白身份：Q96DE0
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2XSQ Crystal structure of human Nudix motif 16 (NUDT16) in complex with IMP and magnesium 提交 2010-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
|
未记录 | IMP INOSINIC ACID × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；PROTEIN WAS MIXED WITH 5MM MGCL2 AND 2MM IDP PRIOR SETTING-UP THE PLATES. THEN IT WAS CRYSTALLIZED FROM 20MM MGCL2, 22% W/V POLYACRYLIC ACID 5100 AND 0.1M HEPES PH 7.5.
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.181 |
| 3COU Crystal structure of human Nudix motif 16 (NUDT16) 提交 2008-03-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
|
突变：A22V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1M CHES pH 9.5, 20% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 3COU Crystal structure of human Nudix motif 16 (NUDT16) 提交 2008-03-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
|
突变：A22V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1M CHES pH 9.5, 20% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 3MGM Crystal structure of human NUDT16 提交 2010-04-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1M imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 5VY2 Crystal structure of the F36A mutant of HsNUDT16 提交 2017-05-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
突变：A22V, F36A 突变：A22V, F36A | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；PEG 8000, CHES
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 5W6X Crystal structure of the HsNUDT16 in complex with Mg+2 and ADP-ribose 提交 2017-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
突变：A22V 突变：A22V | APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ACY ACETIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；PEG 8000, CHES
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 5W6Z Crystal structure of the H24W mutant of HsNUDT16 提交 2017-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
突变：A22V, H24W 突变：A22V, H24W | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；PEG 8000, CHES
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.303 |
| 5W6Z Crystal structure of the H24W mutant of HsNUDT16 提交 2017-06-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–195（195 aa）
链 E
1–195（195 aa）
|
突变：A22V, H24W 突变：A22V, H24W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；PEG 8000, CHES
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.303 |
| 5WJI Crystal structure of the F61S mutant of HsNUDT16 提交 2017-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
突变：A22V, F61S 突变：A22V, F61S | CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；PEG 8000, CHES
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 6B09 Crystal structure of HsNUDT16 in complex with diADPR (soaked) 提交 2017-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
突变：A22V 突变：A22V | C7G [(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S})-5-[[[[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；PEG 8000, CHES
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.279 |
| 6CO2 Structure of an engineered protein (NUDT16TI) in complex with 53BP1 Tudor domains 提交 2018-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M sodium citrate tribasic dehydrate, pH 5.6, 0.2 M ammonium acetate, 10% PEG 4,000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.270 |
| 6X7U Crystal Structure of the Human Nudix Hydrolase Nudt16 in complex with FAD 提交 2020-05-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–184（184 aa）
链 C
1–184（184 aa）
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium chloride and 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.231 |
| 6X7V Crystal Structure of the Human Nudix Hydrolase Nudt16 提交 2020-05-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–195（195 aa）
链 B
1–195（195 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M MES pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.287 |
| 6X7V Crystal Structure of the Human Nudix Hydrolase Nudt16 提交 2020-05-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–195（195 aa）
链 D
1–195（195 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20% (w/v) PEG 3350, 0.1 M MES pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.287 |