当前蛋白身份：Q96G74
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3PFY The catalytic domain of human OTUD5 提交 2010-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
172–339（168 aa）
片段：OTU DOMAIN (UNP Residues 172-339)
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；2% PEG 400, 2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM HEPES, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 3TMO The catalytic domain of human deubiquitinase DUBA 提交 2011-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
172–351（180 aa）
片段：catalytic or OTU domain (Residues 172-351)
|
突变：3.4.19.12 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.8 M succinic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 3TMO The catalytic domain of human deubiquitinase DUBA 提交 2011-08-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
172–351（180 aa）
片段：catalytic or OTU domain (Residues 172-351)
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突变：3.4.19.12 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.8 M succinic acid, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.276 |
| 3TMP The catalytic domain of human deubiquitinase DUBA in complex with ubiquitin aldehyde 提交 2011-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
172–351（180 aa）
片段：catalytic or OTU domain (Residues 172-351)
|
突变：S172 phosphorylated 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；20% PEG3350, 0.2 M Ammonium Fluoride, and 0.1M Bis-Tris, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.227 |
| 3TMP The catalytic domain of human deubiquitinase DUBA in complex with ubiquitin aldehyde 提交 2011-08-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
172–351（180 aa）
片段：catalytic or OTU domain (Residues 172-351)
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突变：S172 phosphorylated 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；20% PEG3350, 0.2 M Ammonium Fluoride, and 0.1M Bis-Tris, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.227 |
| 3TMP The catalytic domain of human deubiquitinase DUBA in complex with ubiquitin aldehyde 提交 2011-08-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
172–351（180 aa）
片段：catalytic or OTU domain (Residues 172-351)
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突变：S172 phosphorylated 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；20% PEG3350, 0.2 M Ammonium Fluoride, and 0.1M Bis-Tris, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.91 Å R-free 0.227 |
| 3TMP The catalytic domain of human deubiquitinase DUBA in complex with ubiquitin aldehyde 提交 2011-08-31 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
172–351（180 aa）
片段：catalytic or OTU domain (Residues 172-351)
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突变：S172 phosphorylated 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；20% PEG3350, 0.2 M Ammonium Fluoride, and 0.1M Bis-Tris, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.91 Å R-free 0.227 |