当前蛋白身份：Q96HY6
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7W3N Crystal structure of Ufm1 fused to UFBP1 UFIM 提交 2021-11-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
194–202（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；28% 2-propanol, 3% PEG 200, 0.1M MES at pH 6.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.200 |
| 8B9X Chimeric protein of human UFM1 E3 ligase, UFL1, and DDRGK1 提交 2022-10-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
207–305（99 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Sodium acetate trihydrate
Ammonium tartrate dibasic
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.272 |
| 8B9X Chimeric protein of human UFM1 E3 ligase, UFL1, and DDRGK1 提交 2022-10-10 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
207–305（99 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Sodium acetate trihydrate
Ammonium tartrate dibasic
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.272 |
| 8C0D UFL1/DDRGK1 bound to UFC1 提交 2022-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
205–314（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；292 K；0.1M HEPES, 1.03M Li2SO4
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.286 |
| 8C0D UFL1/DDRGK1 bound to UFC1 提交 2022-12-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
205–314（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；292 K；0.1M HEPES, 1.03M Li2SO4
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.286 |
| 8OHD 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 3 (native) 提交 2023-03-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–314（314 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8OJ0 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 2 (native) 提交 2023-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–314（314 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8OJ5 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 3 (in-vitro reconstitution) 提交 2023-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric（49） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–314（314 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8QFC UFL1 E3 ligase bound 60S ribosome 提交 2023-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
29–314（286 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 5 mM MgCl2, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9GY4 60S ribosomal subunit in complex with E3-UFM1 ligase and RQC machinery components NEMF and LTN1 (Composite map) 提交 2024-10-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–314（314 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 219 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |