当前蛋白身份:Q96QB1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2DKY Solution structure of the SAM-domain of Rho-GTPase-activating protein 7 提交 2006-04-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–78(78 aa) 片段:SAM-domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1.08mM SAM DOMAIN, 20mM d-TRIS-HCL, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2GYT Solution structure of the SAM (sterile alpha motif) domain of DLC1 (deleted in liver cancer 1) 提交 2006-05-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–76(76 aa) 片段:sterile alpha motif (SAM) domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成 1mM DLC1-SAM 15N, 13C-labaled; 50mM sodium phosphate buffer(pH 7.0); 3mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM DLC1-SAM 15N-labaled; 50mM sodium phosphate buffer(pH 7.0); 3mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KAP Solution structure of DLC1-SAM 提交 2008-11-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 17–76(60 aa) 片段:sterile alpha motif (SAM) domain, UNP residues 17-76
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 1mM DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 5% [U-100% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1mM [U-100% 15N] DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 5% [U-100% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 5% [U-100% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1mM DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 100 % D2O, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 100% D2O, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2LOZ The novel binding mode of DLC1 and Tensin2 PTB domain 提交 2012-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 811–824(14 aa) 片段:UNP residues 811-824
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.2;压力 ambient
NMR样品组成 0.6-0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tensin2-1, 1.2-1.4 mM DLC1-2, 100 mM potassium phosphate-3, 100 mM potassium chloride-4, 1 mM EDTA-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.2-1.4 mM Tensin2-6, 0.6-0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DLC1-7, 100 mM potassium phosphate-8, 100 mM potassium chloride-9, 1 mM EDTA-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.6-0.8 mM [U-100% 13C] Tensin2-11, 1.2-1.4 mM DLC1-12, 100 mM potassium phosphate-13, 100 mM potassium chloride-14, 1 mM EDTA-15, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.2-1.4 mM Tensin2-16, 0.6-0.8 mM [U-100% 13C] DLC1-17, 100 mM potassium phosphate-18, 100 mM potassium chloride-19, 1 mM EDTA-20, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3KUQ Crystal structure of the DLC1 RhoGAP domain 提交 2009-11-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1066–1275(210 aa) 片段:Rho-GAP domain
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;291 K;30% PEG-3350, 0.2M sodium chloride, 5% glycerol, 0.02M HEPES, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
5FZT The crystal structure of R7R8 in complex with a DLC1 fragment. 提交 2016-03-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 467–489(23 aa) 片段:TBS, UNP RESIDUES 467-489
未记录 MLI MALONATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4;15% ETHANOL, 0.1 M TRIS PH 7.4 AT 4OC
分辨率 2.10 Å R-free 0.231