当前蛋白身份:Q96QB1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2DKY Solution structure of the SAM-domain of Rho-GTPase-activating protein 7 提交 2006-04-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–78(78 aa)
片段:SAM-domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.08mM SAM DOMAIN, 20mM d-TRIS-HCL, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2GYT Solution structure of the SAM (sterile alpha motif) domain of DLC1 (deleted in liver cancer 1) 提交 2006-05-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–76(76 aa)
片段:sterile alpha motif (SAM) domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM sodium phosphate;压力 1
NMR样品组成
1mM DLC1-SAM 15N, 13C-labaled; 50mM sodium phosphate buffer(pH 7.0);
3mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM DLC1-SAM 15N-labaled; 50mM sodium phosphate buffer(pH 7.0);
3mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2KAP Solution structure of DLC1-SAM 提交 2008-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
17–76(60 aa)
片段:sterile alpha motif (SAM) domain, UNP residues 17-76
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR样品组成
1mM DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 5% [U-100% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM [U-100% 15N] DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 5% [U-100% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 5% [U-100% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 100 % D2O, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DLC1-SAM, 50mM sodium phosphate, 3mM DTT, 100% D2O, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2LOZ The novel binding mode of DLC1 and Tensin2 PTB domain 提交 2012-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
811–824(14 aa)
片段:UNP residues 811-824
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.2;压力 ambient
NMR样品组成
0.6-0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Tensin2-1, 1.2-1.4 mM DLC1-2, 100 mM potassium phosphate-3, 100 mM potassium chloride-4, 1 mM EDTA-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.2-1.4 mM Tensin2-6, 0.6-0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] DLC1-7, 100 mM potassium phosphate-8, 100 mM potassium chloride-9, 1 mM EDTA-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6-0.8 mM [U-100% 13C] Tensin2-11, 1.2-1.4 mM DLC1-12, 100 mM potassium phosphate-13, 100 mM potassium chloride-14, 1 mM EDTA-15, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1.2-1.4 mM Tensin2-16, 0.6-0.8 mM [U-100% 13C] DLC1-17, 100 mM potassium phosphate-18, 100 mM potassium chloride-19, 1 mM EDTA-20, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 3KUQ Crystal structure of the DLC1 RhoGAP domain 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1066–1275(210 aa)
片段:Rho-GAP domain
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;291 K;30% PEG-3350, 0.2M sodium chloride, 5% glycerol, 0.02M HEPES, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 5FZT The crystal structure of R7R8 in complex with a DLC1 fragment. 提交 2016-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
467–489(23 aa)
片段:TBS, UNP RESIDUES 467-489
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未记录 | MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;15% ETHANOL, 0.1 M TRIS PH 7.4 AT 4OC
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分辨率 2.10 Å R-free 0.231 |