当前蛋白身份:Q96RP9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6VLZ Structure of the human mitochondrial ribosome-EF-G1 complex (ClassI) 提交 2020-01-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 85 PDB 声明:90-meric(90) 与全部聚合物一致
链 v 1–751(751 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
6VMI Structure of the human mitochondrial ribosome-EF-G1 complex (ClassIII) 提交 2020-01-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 85 PDB 声明:91-meric(91) 与全部聚合物一致
链 v 1–751(751 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 89 PDB 声明:94-meric(94) 与全部聚合物一致
链 BC 37–751(715 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 89 PDB 声明:95-meric(95) 与全部聚合物一致
链 BC 37–751(715 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
7A5K Structure of the human mitoribosome in the post translocation state bound to mtEF-G1 提交 2020-08-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 86 PDB 声明:93-meric(93) 与全部聚合物一致
链 r1 1–751(751 aa)
未记录 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 128 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 7 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å