当前蛋白身份:Q99250 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2KAV Solution structure of the human Voltage-gated Sodium Channel, brain isoform (Nav1.2) 提交 2008-11-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1777–1882(106 aa) 片段:C-terminal EF-Hand Domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;290.5 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 100 mM [D5-98%] glycine, 20 mM [D11-98 %] TRIS, 0.1 mM [D16-98%] EDTA, 10 % [U-99% 2H] D2O, 1 mM [D10-98%] DTT, 0.02 % NaN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-10% 13C; U-99% 15N] protein, 100 mM [D5-98%] glycine, 20 mM [D11-98 %] TRIS, 0.1 mM [D16-98%] EDTA, 10 % [U-99% 2H] D2O, 1 mM [D10-98%] DTT, 0.02 % NaN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 100 mM [D5-98%] glycine, 20 mM [D11-98 %] TRIS, 0.1 mM [D16-98%] EDTA, 10 % [U-99% 2H] D2O, 1 mM [D10-98%] DTT, 0.02 % NaN3, 15 mg pF1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4JPZ Voltage-gated sodium channel 1.2 C-terminal domain in complex with FGF13U and Ca2+/calmodulin 提交 2013-03-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1777–1937(161 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 7.5;290 K;14% pEG3350, 300 mM sodium acetate,50 mM Tris pH 7.5, and 2 mM CaCl2, EVAPORATION, temperature 290K
分辨率 3.02 Å R-free 0.246
4JPZ Voltage-gated sodium channel 1.2 C-terminal domain in complex with FGF13U and Ca2+/calmodulin 提交 2013-03-19 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 H 1777–1937(161 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 7.5;290 K;14% pEG3350, 300 mM sodium acetate,50 mM Tris pH 7.5, and 2 mM CaCl2, EVAPORATION, temperature 290K
分辨率 3.02 Å R-free 0.246
6BUT Solution structure of full-length apo mammalian calmodulin bound to the IQ motif of the human voltage-gated sodium channel NaV1.2 提交 2017-12-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1901–1927(27 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成 0.950 mM U-99% C13, U-99% N15 Calmodulin, 0.950 mM U-99% C13, U-99% N15 voltage-gated sodium channel NaV1.2 IQ motif, 0.1 mM U-98% 2H EDTA, 100 mM KCl, 10 mM [U-99% 2H] imidazole, 0.01 % w/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.95 mM U-99% C13, U-99% N15 Calmodulin, 0.95 mM U-99% C13, U-99% N15 voltage-gated sodium channel NaV1.2 IQ motif, 0.1 mM U-98% 2H EDTA, 100 mM potassium chloride, 10 mM [U-99% 2H] imidazole, 0.01 % w/v sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6J8E Human Nav1.2-beta2-KIIIA ternary complex 提交 2019-01-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–2005(2005 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å