当前蛋白身份:Q9A8S9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
9PFQ The cryo-EM structure of C. crescentus DriD-ssDNA-RNAP-Sigma73-bapE promoter transcription activation complex 提交 2025-07-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致
链 A 1–338(338 aa)
链 B 1–338(338 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
9PFV The cryo-EM structure of C. crescentus DriD-ssDNA-RNAP-Sigma73-CCNA_03891/CCNA_01149 promoter transcription activation complex 提交 2025-07-06 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 A 1–338(338 aa)
链 B 1–338(338 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9PGA The cryo-EM structure of C. crescentus DriD-ssDNA-RNAP-Sigma73-didA promoter transcription activation complex 提交 2025-07-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致
链 A 1–338(338 aa)
链 B 1–338(338 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
9PGH The cryo-EM structure of C. crescentus RNAP-Sigma73-CCNA_03891/CCNA_01149 promoter complex 提交 2025-07-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 A 1–338(338 aa)
链 B 1–338(338 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 251–329(79 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.242
9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 251–329(79 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.242
9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 Assembly 3 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 251–329(79 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.242
9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 251–329(79 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.242
9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 E 251–329(79 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.242