当前蛋白身份:Q9A8S9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9PFQ The cryo-EM structure of C. crescentus DriD-ssDNA-RNAP-Sigma73-bapE promoter transcription activation complex 提交 2025-07-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–338(338 aa)
链 B
1–338(338 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.24 Å |
| 9PFV The cryo-EM structure of C. crescentus DriD-ssDNA-RNAP-Sigma73-CCNA_03891/CCNA_01149 promoter transcription activation complex 提交 2025-07-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–338(338 aa)
链 B
1–338(338 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9PGA The cryo-EM structure of C. crescentus DriD-ssDNA-RNAP-Sigma73-didA promoter transcription activation complex 提交 2025-07-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–338(338 aa)
链 B
1–338(338 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 9PGH The cryo-EM structure of C. crescentus RNAP-Sigma73-CCNA_03891/CCNA_01149 promoter complex 提交 2025-07-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–338(338 aa)
链 B
1–338(338 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-cl, 5 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 1 mM BME
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
251–329(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |
| 9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
251–329(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |
| 9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 C
251–329(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |
| 9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
251–329(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |
| 9ZUM Structure of the Caulobacter crescentus RNAP alpha-CTD bound to AT rich DNA 提交 2025-12-24 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
251–329(79 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1-2% PEG 2000 MME, 1 mM Ammonium sulphate, 20 mM sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.242 |