当前蛋白身份:Q9BQB6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6WV3 Human VKOR with warfarin 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 SWF S-WARFARIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;37% PEG400, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 6WV4 Human VKOR C43S with warfarin 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
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突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SWF S-WARFARIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;25-33% PEG400, 185-220 mM potassium formate, 0.1 M MES, pH 6.5
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分辨率 3.01 Å R-free 0.292 |
| 6WV5 Human VKOR C43S mutant with vitamin K1 epoxide 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
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突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UAV (2R,3R)-2-hydroxy-3-methyl-2-[(2E,7S)-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-en-1-yl]-2,3-dihydronaphthalene-1,4-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;25% PEG400, 0.1 M ammonium citrate dibasic, 0.1 M MES, pH 6.5
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分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 6WV6 Human VKOR with phenindione 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 UAS Phenindione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;34% PEG400, 80 mM lithium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5
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分辨率 2.70 Å R-free 0.268 |
| 6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UAJ Chlorophacinone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.245 |
| 6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UAJ Chlorophacinone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.245 |
| 6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UA7 Brodifacoum × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
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分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
3–155(153 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UA7 Brodifacoum × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |