当前蛋白身份:Q9BQB6 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6WV3 Human VKOR with warfarin 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 SWF S-WARFARIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;37% PEG400, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.223
6WV4 Human VKOR C43S with warfarin 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SWF S-WARFARIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;25-33% PEG400, 185-220 mM potassium formate, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 3.01 Å R-free 0.292
6WV5 Human VKOR C43S mutant with vitamin K1 epoxide 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) UAV (2R,3R)-2-hydroxy-3-methyl-2-[(2E,7S)-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-en-1-yl]-2,3-dihydronaphthalene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;25% PEG400, 0.1 M ammonium citrate dibasic, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.270
6WV6 Human VKOR with phenindione 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 UAS Phenindione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;34% PEG400, 80 mM lithium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) UAJ Chlorophacinone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.48 Å R-free 0.245
6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) UAJ Chlorophacinone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 2.48 Å R-free 0.245
6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) UA7 Brodifacoum × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 1.99 Å R-free 0.215
6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 3–155(153 aa) 片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) UA7 Brodifacoum × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
分辨率 1.99 Å R-free 0.215