当前蛋白身份:Q9BRJ7 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3KVH Crystal structure of human protein syndesmos (NUDT16-like protein) 提交 2009-11-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 6–211(206 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M hepes pH 7.5, 20%w/v jeffamine M-600, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.217
5ZCJ Crystal structure of complex 提交 2018-02-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 6–211(206 aa)
链 B 6–211(206 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;293 K;0.7 M Ammonium tartrate, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
6CO1 Structure of human TIRR in complex with 53BP1 Tudor domains 提交 2018-03-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 6–211(206 aa)
链 B 6–211(206 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M MES, pH 5.5, 0.2 M calcium acetate, 7% isopropanol
分辨率 2.18 Å R-free 0.203
6CO1 Structure of human TIRR in complex with 53BP1 Tudor domains 提交 2018-03-10 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 6–211(206 aa)
链 D 6–211(206 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.1 M MES, pH 5.5, 0.2 M calcium acetate, 7% isopropanol
分辨率 2.18 Å R-free 0.203
6D0L Structure of human TIRR 提交 2018-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 6–211(206 aa)
链 B 6–211(206 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;0.06 M citric acid, 0.04 M Bis-Tris-Propane, pH 4.1, 16% PEG 3,350; Cryoprotection in 25% PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.209
8U3S Structure of human TIRR in complex with VHH4 nanobody 提交 2023-09-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 6–211(206 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;Crystals were produced by the hanging-drop vapor diffusion method by mixing 2 microliters of the protein (in 10 mM HEPES, 50 mM NaCl, 2 mM TCEP, pH 7.5) and 2 microliters of the reservoir solution made up of 8% Tacsimate, pH 5, and 20% PEG 3,350
分辨率 1.85 Å R-free 0.271