当前蛋白身份：Q9BSB4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4WZG Structure of human ATG101 提交 2014-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：MONOMERIC（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–218（218 aa）
|
未记录 | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；PEG3350, MES, NACL, BME
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.220 |
| 5C50 Crystal structure of the complex of human Atg101-Atg13 HORMA domain 提交 2015-06-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
片段：UNP residues 1-198
|
未记录 | BEN BENZAMIDINE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；19% PEG 3350, 0.5 M benzamidine, and
0.2 M lithium citrate
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.195 |
| 5XUY Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 5XUY Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 5XV1 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.251 |
| 5XV1 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.251 |
| 5XV3 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.283 |
| 5XV3 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.283 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV4 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.313 |
| 5XV6 Crystal structure of ATG101-ATG13HORMA 提交 2017-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
|
突变：K40A/K41A/E42A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES (pH7.5), 0.2M MgCl2, 6-8% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.271 |
| 8DO8 Crystal structure ATG9 HDIR in complex with the ATG13:ATG101 HORMA dimer 提交 2022-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–198（198 aa）
链 F
1–198（198 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；273 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M
NaCl, 12% PEG8000
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.251 |
| 8DO8 Crystal structure ATG9 HDIR in complex with the ATG13:ATG101 HORMA dimer 提交 2022-07-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–198（198 aa）
链 E
1–198（198 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 22 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；273 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M
NaCl, 12% PEG8000
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.251 |